Cell Reports Medicine新成果为直肠癌治疗提供重要线索

2023年10月18日，国家基因库生命大数据平台支撑科研成果在《Cell Reports Medicine》发表。该研究题为“Cancer-associated fibroblasts undergoing neoadjuvant chemotherapy suppress rectal cancer revealed by single-cell and spatial transcriptomics”，使用单细胞测序技术和空间转录组技术揭示了直肠癌在新辅助化疗下，肿瘤微环境的动态变化图谱和耐药性影响。

本研究中单细胞及空间转录组处理后的表达数据已存储于国家基因库生命大数据平台（CNGBdb），项目编号为：CNP0004138。

越来越多的证据表明新辅助化疗(NAC)可以促进肿瘤微环境(TME)的抗肿瘤免疫反应，从而促进其在肿瘤治疗中的应用。然而，NAC对TME的调节及其与治疗反应的关系仍不清楚。

此项研究招募了29名接受NAC治疗的 pMMR/MSS 直肠癌（RC）患者。大部分样本都是在治疗前后成对采集的，并根据治疗反应进行分类，以便于进行不同治疗方法或结果的比较研究。研究团队使用单细胞测序技术和空间转录组技术表征肿瘤的异质性和空间结构

研究团队构建了由NAC重塑的高分辨率细胞动态图谱及其与治疗反应的关联。NAC显著重塑了癌症相关成纤维细胞（CAFs）群，这与治疗反应密切相关。

重塑的癌相关成纤维细胞亚群通过空间招募和串联调节TME，以激活免疫并通过多种细胞因子（包括CXCL12、SLIT2和DCN）抑制肿瘤进展。与此相反，CAF_FAP通过MIR4435-2HG诱导上调恶性细胞的上皮-间质转化，导致预后恶化。

此项研究表明：NAC通过重塑CAFs来抑制肿瘤进展和调节TME。

中山大学第六附属医院林宏城副主任和任东林主任，华大生命科学研究院刘石平研究员和吴靓副研究员、华南理工大学王菊芳教授，为该论文的共同通讯作者。华大生命科学研究院秦鹏飞副研究员、博士研究生王宇航、算法开发工程师黄可、中山大学博士后陈华显和黄亮主任为该论文的共同第一作者。

该项目得到广东省自然科学基金杰出青年项目(No.2022B1515020003)、国家自然科学基金(No.82174369和81973847)、广东省自然科学基金(No.2020A1515011254)、广州地区临床高新重大和特色技术项目(No.2023P-GX09)、白求恩慈善基金会(No.zllcaxw-14)、华大研究院开放基金项目(No.BGIRSZ20210005)、国家重点研发计划（No.2021YFA0805100和2021YFC2501900）、广东省基础与应用基础研究基金会(No. 2021A1515110832)等基金的支持，同时也得到了国家基因库（www.cngb.org）的支持。该项目严格遵照伦理规范开展，相关数据已完成中国人类遗传资源信息开放使用备案。

原文链接：https://doi.org/10.1016/j.xcrm.2023.101231 部分信息来源于：“华大集团BGI”公众号。