文献解读

CNSA目前已支撑发表多篇文献,覆盖方法学、数据库、植物、动物、微生物、疾病等方向。

热点综述 | 高维单细胞RNA测序数据分析工具

摘要:针对scRNA-seq分析所需的不同步骤进行广泛概述,包括数据的预处理和下游分析讨论了在scRNA-seq数据分析的每个步骤中通常会遇到的挑战,并研究了为解决这些问题而开发的不同计算工具和方法,包括它们的优势和局限性还探讨了实验设计的选择如何影响下游的数据分析。

2021-06-15102

【珍藏版】热点综述 | 单细胞多组学研究怎么做?

摘要:介绍了单细胞多组学分析技术(mRNA-基因组mRNA-DNA甲基化mRNA-染色质可及性mRNA-蛋白质)以及单细胞多组学数据的综合分析方法。

2021-05-183073

从全标本到单细胞空间组,基因表达实现“3D”分析 | 空间组学技术综述

摘要:此综述探讨了目前用于阐明空间表达的技术,解释了准确地定量捕捉空间基因表达数据的能力。

2021-05-063080

STUtility:一个为空间转录组学数据提供全流程分析的工具

摘要:一个为空间转录组学数据提供完整工作流程的工具,从测序和图像数据处理到组织的最终三维模型的创建。

2021-04-233217

热点综述 | m6A × 肿瘤相关lncRNA研究思路

摘要:总结了m6A修饰在肿瘤相关lncRNAs的调控和功能中的作用,同时讨论了该领域的潜在应用和未来可能的发展方向。

2021-04-19493

Nature 子刊:13种scRNA-seq技术基准测评报告

摘要:来自西班牙瑞典英国德国澳大利亚等多国研究团队共同对13种scRNA-seq方法开展基准测评,相关研究成果已发表在《Nature Biotechnology》杂志。

2021-04-06373

SpatialCPie:用于空间转录组聚类评估的工具

摘要:SpatialCPie,一个易于使用的R包,可以让用户直观地了解ST数据中的“簇”是如何相互关联的,以及二维ST阵列上的每个区域与每个“簇”的关联程度。

2021-04-02371

空间转录组技术在肿瘤免疫治疗中的应用潜力

摘要:为了提高免疫疗法的疗效,研究人员已经使用空间转录组技术来识别并随后阻断肿瘤异质性的来源。

2021-03-29313

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