文献解读

CNSA目前已支撑发表多篇文献,覆盖方法学、数据库、植物、动物、微生物、疾病等方向。

SpatialTE:从空间转录组数据集分析转座因子表达的工具 | 空间转录组分析工具推荐

摘要:以空间分辨率的方式进行TE表达分析,可以进一步帮助了解它们在组织内基因调节中的作用。

2022-01-1812

超全 | PCR引物设计-免费软件合辑

摘要:此前《Bioinformatics》发表了一篇题为“Classification and review of free PCR primer design software”的综述文章,对目前可用的免费PCR引物设计软件进行分类和回顾性总结。

2022-01-1715

盘点季 | 空间转录组工具合辑(下):聚类

摘要:新兴的空间转录组(ST)领域的技术发展开辟了一个未经探索的领域,将转录信息置于空间环境中。聚类通常是分析这类数据的核心组成部分。

2022-01-1359

药物基因组学综述 | 药物不良反应研究相关数据库和生物信息学方法

摘要:总结了药物不良反应研究的技术数据库数据分析方法等,还探讨了临床应用建议。

2022-01-1051

盘点季 | 空间转录组分析工具合辑(上):去卷积

摘要:细胞类型去卷积,是用于估计混合物(数据点)中每种细胞类型的比例以及每个细胞的基因表达水平(在同一数据点内)的算法。

2022-01-05124

ClusterMap:用于空间基因表达的多尺度聚类分析 | 空间转录组分析工具推荐

摘要:ClusterMap广泛适用于各种原位转录组技术,从高维转录组图谱图像中揭示基因表达模式细胞生态位和组织结构原理。

2021-12-14308

植物转录组学前沿领域:在植物中实现单细胞、空间分辨率的转录组学

摘要:简要回顾了空间转录组学方法的发展,并强调了目前在植物中实现三维空间转录组学的实验和计算方面的进展和挑战,特别关注这种方法如何接近单细胞分辨率。同时还确定并探讨了在植物学中进一步推进空间转录组学的潜在机会。

2021-12-06189

Annu Rev Neurosci.综述:神经解剖学中的空间转录组学

摘要:回顾了在推进神经解剖学的背景下空间转录组学所带来的技术和概念进步,并讨论了分子神经解剖学如何重新定义神经系统定位。

2021-11-29444

DSTG:基于图形的卷积网络对空间转录组数据进行去卷积

摘要:一个基于图形的卷积网络对空间转录组数据进行去卷积的新方法:DSTG。

2021-11-23467

BT × IT | 如何利用神经网络做空间转录组分析?

摘要:随着生物与信息融合(BT与IT融合)发展,越来越多的IT技术已实际应用于BT问题,例如今天小编介绍的这三个利用神经网络进行空间转录组分析的方法

2021-11-22253

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