文献解读

CNSA目前已支撑发表多篇文献,覆盖方法学、数据库、植物、动物、微生物、疾病等方向。

Nat Methods | 单细胞多组学整合算法的基准测试

《Nature Methods》发表综述文章,使用47 个单细胞多组学数据集对14种蛋白质丰度/染色质可及性预测算法和18种单细胞多组学整合算法进行了基准研究。

2024-11-12190

用于物种识别的DNA条形码常用引物(微生物篇)

DNA条形码利用一个或多个标准化的短DNA区域进行分类识别。

2024-11-06152

用于物种识别的DNA条形码常用引物(动植物、原生生物篇)

DNA条形码利用一个或多个标准化的短DNA区域进行分类识别。

2024-10-30127

使用高通量测序技术检测植物虫害的实验指南(下)

2022年,《EPPO Bulletin》发表文章介绍了HTS应用于植物害虫检测的一般建议(例如实验室和计算基础设施质量管理体系)和技术要求,以便实验室为实施植物害虫诊断的HTS技术做好准备,其涵盖了HTS过程的所有步骤。

2024-10-24100

使用高通量测序技术检测植物虫害的实验指南(上)

2022年,《EPPO Bulletin》发表文章介绍了HTS应用于植物害虫检测的一般建议(例如实验室和计算基础设施质量管理体系)和技术要求,以便实验室为实施植物害虫诊断的HTS技术做好准备,其涵盖了HTS过程的所有步骤。

2024-10-16182

NC | VolcanoSV可通过单分子长读长测序在二倍体基因组中实现准确、稳健的结构变异调用

《Nature Communications》发表了一种创新的混合SV检测流程VolcanoSV,其同时利用参考基因组和局部从头组装生成分阶段二倍体组装利用阶段性SNP和独特的k-mer相似性分析,可以精确地发现单倍型解析的SV。

2024-10-14139

物种鉴定工具 | phyloBARCODER:使用自定义参考数据库对真核生物Metabarcodes进行系统发育分类的web工具

《Molecular Biology and Evolution》发表了一个新的web工具phyloBARCODER,可以使用Metabarcodes在物种水平上识别短DNA序列。

2024-09-25110

BRIEF FUNCT GENOMICS | 基因组学研究常用在线资源合集

2024年7月《Briefings in Functional Genomics》发表综述文章,概述了人类基因组学研究中使用率较高的50多种在线资源。

2024-09-11416

肿瘤研究工具 | PERCEPTION:利用肿瘤单细胞转录组学预测患者对治疗的反应和耐药性

PERCEPTION(PERsonalized Single-Cell Expression-Based Planning for Treatments In ONcology,基于单细胞表达的肿瘤精准治疗规划)。

2024-09-02255

scHiCyclePred:利用多尺度交互信息从单细胞 Hi-C 数据中预测细胞周期阶段

2024年7月,《Communications Biology》发表了一个预测模型 scHiCyclePred,其整合了多种特征集,利用 scHi-C 数据来预测细胞周期阶段。

2024-08-26160

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