文献解读

CNSA目前已支撑发表多篇文献,覆盖方法学、数据库、植物、动物、微生物、疾病等方向。

热点综述 | 跨模态单细胞分析的最佳实践

摘要:近日《Nature Reviews Genetics 》发表了一篇综述文章,总结了单模态和多模态单细胞数据分析的独立基准研究,为最常见分析步骤提供全面的最佳实践工作方案。

2023-04-232134

数据存在CNGBdb,可以发哪些杂志?【J TRANSL MED】 |CNGBdb-Question Time

摘要:Journal of Translational Medicine是一本开放获取的期刊,重点关注人类实验中的信息,以优化基础科学和临床科学之间的沟通。

2023-04-191980

数据分析工具推荐 | adaptive-m6A:从RNA序列中鉴定物种特异性m6A修饰位点

摘要:近日,《Briefings in Bioinformatics》发表了一种基于注意力的深度学习方法adaptive-m6A,用于识别多个物种中的m6A位点。

2023-04-132059

Nature Methods | 空间组学数据库推荐:SODB

摘要:2023年2月,《Nature Methods》发表了一个综合性的空间组学数据库:SODB。

2023-04-11642

热点综述 | 基于人工智能的多组学分析助力癌症精准医学研究

摘要:2023年1月《Seminars in Cancer Biology》发表了一篇综述文章,全面总结了基于人工智能的多组学肿瘤分析的最新进展,重点介绍了基于人工智能的多组学技术在癌症诊断分类早期筛查反应评估和预后预测方面的应用。

2023-04-03867

Nat. Methods | COMMOT:利用最优运输进行空间转录组细胞间通讯分析

摘要:近日《Nature Methods 》发表了一种处理复杂分子相互作用和空间约束的最优运输方法:COMMOT,推断空间转录组学中的CCC。

2023-03-30414

NBT | 使用CytoSPACE对单细胞和空间转录组进行高分辨率比对

摘要:近日,《Nature Biotechnology》发表了一种将单个细胞从scRNA-seq图谱映射到空间表达谱的优化方法:CytoSPACE。

2023-03-27230

疾病研究资源 | 用于评估疾病相关性的生物医学数据、计算方法和工具

摘要:2022年《Briefings in Bioinformatics》发表了一篇综述文章,为当前的疾病关联研究提供了一个系统的概述:总结了用于评估疾病相关性的可用生物医学数据和数据库计算方法软件工具/平台等,以促进疾病关联计算方法和工具/平台的开发和应用。

2023-03-20845

NC | 使用GraphST对空间转录组进行空间信息聚类、整合和去卷积

摘要:《Nature Communications》发表了一种图自我监督的对比学习方法:GraphST,其充分利用空间转录组学数据,以优于现有方法。

2023-03-16441

2023NAR数据库特刊:单细胞数据库合辑

摘要:今年1月2023 Nucleic Acids Research Database Issue上线,包含178 篇涉及生物学和相关领域的论文:其中90篇论文报告了新数据库82篇更新了该期先前发表的资源6篇提供了最近在其他期刊发表的数据库的更新。

2023-02-20950

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