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不定期推荐好用的科学数据库

为了不看文献,我又找到了一个宝藏数据库 | 微生物-疾病关联研究数据库

摘要:一个得到实验支持的微生物-疾病关联数据库Peryton

2021-03-12112

GRNdb:单细胞水平的基因调控网络数据库

摘要:一个免费的人类和小鼠数据库,旨在方便搜索和分析转录因子(TFs)和下游靶基因(称为调控子)在各种组织/条件下形成的调控网络。

2021-02-08170

做lncRNA富集分析,你需要它:lncSEA

摘要:来自哈尔滨医科大学的研究团队开发了LncSEA,一个专注于容纳人类lncRNA的各种可用资源的数据库,该数据库可直接对用户提交的lncRNA进行注释和富集分析。

2021-01-21404

ColorCells:一个轻松完成单细胞lncRNA分析的数据库

摘要:来自中山大学的研究团队开发了ColorCells:一个用于比较分析单细胞RNA-Seq数据中lncRNAs表达分类和功能的数据库。研究人员还将ColorCells应用于6个物种的167913个公开的scRNA-Seq数据集,发现了一批细胞特异性lncRNAs。

2021-01-14264

喏,这就是你缺的那个lncRNA-靶基因调控分析工具 | lncRNA数据库推荐

摘要:LncTarD提供了人类疾病中关键的lncRNA靶标调控及其影响功能和lncRNA介导的调控机制,可以作为了解lncRNA在疾病发病中的功能和分子机制的及时而有价值的资源,这将有助于发现人类疾病中新的和敏感的生物标志物和治疗靶点。

2021-01-08198

你比对的参考基因组有更新哟!Science发布最新猕猴参考基因组~

摘要:来自美国的研究团队在《Science》发表其最新研究成果:通过多平台基因组学方法研究团队组装完成了最新的猕猴参考基因组,并确定了超过8500万个遗传变异。

2021-01-05276

从CNS封面文章中找数据 | Nature:人类癌症细胞系的转移图谱

摘要:来自美国的研究团队将一种体内条形码策略应用于横跨21种实体瘤的500个细胞系,绘制了人类癌症细胞系的转移图谱(MetMap),揭示了器官特异性转移模式,使这些模式与临床和基因组特征相关联。

2020-12-22238

小编亲测,这个国产人类疾病单细胞数据库值得推荐~

摘要:来自西北工业大学西安交通大学哈尔滨工业大学复旦大学和天津大学的研究团队共同开发了一个人工整理的人类疾病单细胞转录组数据库:SC2disease,旨在为不同疾病的不同细胞类型的基因表达谱提供全面准确的资源。

2020-12-17284

单细胞数据资源 | Cell:埃博拉病毒病的单细胞图谱分析揭示了病毒与宿主的动态变化

摘要:研究人员开发了第一个基于CyTOF和Seq-Well高维单细胞技术的BSL-4研究平台。对EBOV感染的21只恒河猴的共90个外周血单核细胞(PBMCs)样本进行分析,并进一步在体外用EBOV感染PBMCs,并通过Seq-Well分析基因表达图谱,剖析宿主与病毒的相互作用,全面表征细胞在EVD过程中的状态和动态变化。

2020-12-15260

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