PVD: 病原数据库


病原数据库收录引起人类感染性疾病的病原微生物,包括病原分类、生物学特征、疾病表型、核酸序列以及病人免疫特征。提供对病原微生物的检索、鉴定工具,为临床科研提供帮助与指导,包括三个子库:慢性传染病病原数据库、新发传染病病原数据库、重大传染病病原数据库。

病原鉴定


主要的包含数据库


1 慢性传染病病原数据库

慢性传染病,顾名思义,即病原感染引起疾病过程不激烈或存在一定潜伏期,疾病发生后治疗或者痊愈需要较长的时间,甚至终身携带,主要包括病毒性肝炎、艾滋病、结核病、血吸虫病等。慢性传染病病原数据库收录HIV、HBV和TB的病原分类信息、核酸信息,以及提供信息检索工具、型别和耐药鉴定工具。

2 新发传染病病原数据库

新发传染病是指近几十年来新发现的新种或新型病原微生物引起的传染病。20世纪70年代以来,除少数年份外,每年大都有一种或一种以上的新传染病被发现,新发传染病至今达40余种,但是随着科学技术的进步,每年新发现的病原种类(包括新亚型)越来越多。病原微生物种类复杂,有病毒、细菌、立克次体、衣原体、螺旋体及寄生虫,每个种类都有较大差异,并且在与人体免疫、治疗对抗过程中,不断有新的变异、新的亚型产生,数据库的积累和新鉴定技术的发明将越来越重要。如今,新发传染病已成为全球现今重要的公共卫生问题之一,对整个人类构成严重威胁,其不分年龄、性别、生活方式、伦理背景和社会经济状况,但是新发传染病的爆发又呈现地域差异性,如埃博拉出血热在非洲以其极强的传染性、极高的死亡率而被称为“死亡天使”;禽流感等主要在中国等一些东亚以及东南亚地区爆发;zika病毒在热带、亚热带地区大规模流行等等。新发传染病病原数据库主要收录禽流感、zika、登革热病毒,提供不行株型、亚型、变异的快速检索与比对工具,同时结合宏病毒组研究技术,收录宏病毒组、宏基因组信息,实现病原快速鉴定功能,提供病原快速鉴定工具。

3 重大传染病病原数据库

本数据库定义的重大传染病,指不定时得每年都发生的在短时间内发生、波及范围广泛,出现大量的病人或死亡病例。病原收录主要集中在鼠疫杆菌、霍乱弧菌、沙门菌、包虫等病原体信息。包括信息检索系统,型别、进化、示踪、耐药、毒力鉴定系统,为感染病研究与疾病防控提供辅助与支持。