CCDA-seq:一种单分子层级研究ecDNA染色质开放性的新技术

摘要:华大基因唐冲博士团队在表观遗传与染色质研究权威期刊Epigenetics & Chromatin上发表题为"Sequencing of methylase-accessible regions in integral circular extrachromosomal DNA reveals differences in chromatin structure"的论文,开发出一种单分子层级研究ecDNA染色质开放性的新技术 CCDA-seq。

2021-09-238

CoSTA:用于空间转录组分析的无监督卷积神经网络学习方法

摘要:CoSTA:一种通过卷积神经网络(ConvNet)聚类学习基因表达矩阵之间空间相似性的新方法。

2021-09-2212

中国在竹子群体遗传研究方面取得重要突破! | CNGBdb支撑发表科研成果速递

摘要:通过对427个毛竹个体基因组的分析,揭示了毛竹种群结构的特点以及材性性状的遗传基础。

2021-09-1669

如何在CNGBdb快速、批量上传数据?试试Aspera吧~ | CNGBdb-Question Time

摘要:2021年7月,CNSA新增了Aspera命令行数据上传方式。

2021-09-1566

前沿综述 | 利用机器学习进行多组学数据分析

摘要:探讨了多组学的数据整合机器学习方法及其应用(被用来深入了解正常生理功能和疾病存在时的生物系统),为计划在多组学研究中使用ML方法的跨学科专业人士提供见解和建议。

2021-09-14141

PNAS发表海洋哺乳动物演化研究重要成果

摘要:揭示了海洋哺乳动物适应海洋环境及其趋同演化的重要遗传机制。

2021-09-1371

数据存在CNGBdb,可以发哪些杂志?【Science Advances】 | CNGBdb-Question Time

摘要:Science Advances是美国科学促进会 (AAAS) 的开放获取多学科期刊,在科学领域发表有影响力的研究论文和综述,包括特定学科和广泛的跨学科领域。

2021-09-08161

盘点 | 空间转录组下游分析工具大PK,你在用哪个?

摘要:来自澳大利亚的研究团队回顾了用于分析不同空间分辨率转录组学(SRT)数据集的可用软件包和流程,重点是识别空间变异基因(SVG)以及其他目标,同时讨论了在生物数据中建立标准化“ground truth”以进行基准测试的重要性和挑战。

2021-09-062102

Nature子刊 | scArches:单细胞数据 × 深度学习新策略

摘要:一种新的深度学习策略:scArches,使用迁移学习和参数优化来实现高效分散迭代的参考图谱构建和新数据集与现有参考图谱的关联,而无需分享原始数据。

2021-09-02276

数据存在CNGBdb,可以发哪些杂志?【Nature Plants】 | CNGBdb-Question Time

摘要:Nature Plants是一份仅限在线的月刊,发表关于植物的最佳研究从它们的进化发育新陈代谢和环境相互作用到它们的社会意义。

2021-09-01222

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