单细胞工具 | scGPT:利用生成式AI构建单细胞多组学基础模型

摘要:2024年2月,《Nature Methods》发表单细胞生物学的基础模型 scGPT,该模型是基于跨越3300多万个细胞库的生成式预训练转换器。

2024-03-04186

Aging Cell新成果揭示肠道微生物对人类衰老的潜在作用

摘要:研究团队发现,人类衰老过程中的肾功能下降可能与肠道微生物和血清代谢物的变化有关。

2024-02-28332

Nat. Biotechnol. | iStar:通过整合空间转录组学与组织学推断超分辨率组织结构

摘要:《Nature Biotechnology 》发表了一种基于分层图像特征提取的方法 iStar,其能整合ST数据和高分辨率组织学图像,以超分辨率预测空间基因表达。

2024-02-26283

单细胞工具 | 利用CellHint自动协调和整合人类细胞图谱数据集的细胞类型

摘要:2023年12月,《Cell》发表了一种基于树的预测聚类工具CellHint,用于解决数据集之间在注释分辨率和技术偏差方面的细胞类型差异。

2024-02-21550

Cell Metabolism发布首个灵长类代谢疾病下丘脑细胞图谱

摘要:本研究提供了一个全面的灵长类下丘脑单细胞和空间基因表达图谱,揭示了肥胖和糖尿病对下丘脑的差异性转录变化。这些发现不仅为研究下丘脑的代谢调控功能提供了丰富资源,有助于更好地理解代谢疾病发生的机制,也能够为肥胖和糖尿病提供更精确有效的治疗策略。

2024-02-19443

数据资源推荐 | 轻木、檀香紫檀等11种珍贵木材染色体级基因组图谱

摘要:来自深圳华大生命科学研究院西南林业大学西安交通大学华南植物园以及中国科学院分子植物科学卓越创新中心的研究人员成功为轻木檀香紫檀等11种具有重要经济和生态价值的木材树种构建了高质量染色体级别的基因组序列图谱。

2024-02-17317

NC | scSpaMet:用于组织系统生物学的单细胞空间代谢组学与细胞类型特异性蛋白质分析

摘要:scSpaMet框架,通过将非靶向空间代谢组学和靶向多路蛋白成像整合到单一分析流程中,对人体组织中的单个免疫细胞和癌细胞进行蛋白质-代谢组学联合分析。

2024-02-05296

数据存在CNGBdb,可以发哪些杂志?【JCI Insight】| CNGBdb-Question Time

摘要:JCI Insight是一本致力于生物医学研究(从临床前研究到临床研究)的同行评审期刊。

2024-01-3178

单细胞工具 | SnapATAC2:快速、可扩展、多功能的单细胞组学数据分析工具

摘要:2024年1月,《Nature Methods》发表了一种非线性降维算法SnapATAC2,不仅实现了对单细胞组学数据异构性的更精确捕获,而且还确保了高效的运行时间和内存使用,随细胞数线性扩展。

2024-01-29121

Nature子刊 | Communications Biology发表子痫前期患者外周免疫细胞特征图谱

摘要:利用DNBelab C4平台构建了子痫前期患者外周免疫细胞图谱,全面对比了健康孕妇与子痫前期患者免疫细胞的差异,系统揭示了患者外周免疫细胞的异常分子特征,并据此开发了可用于疾病早期筛查的新型人工智能算法。

2024-01-2484

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