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Biomigo主要支持英文关键词搜索,例如:物种:(Struthio camelus)样本:CNGB2013SIBVGS0542基因:TP53突变:rs746619515染色体位置:9:107200711-107200711疾病:lung cancer

项目总览


Biomigo

Biomigo 是基于CGA(CNGB Global Archive)的生物数据基础库,提供全数据检索服务,整合了大量生物数据资源,覆盖基因、变异、表达、蛋白和表型等数据。

CGA

CGA(CNGB Global Archive)是一个生物数据共享和数据应用服务的统一平台。平台提供科研数据存储和共享服务,实现生物数据自动化管理及归档,可进行全数据检索和下载,同时提供生物大数据的智能计算服务。

数据库

数据库涵盖的方向包括人(疾病)类数据库,农业类数据库,动物类数据库,植物数据库,病毒数据库等。

数据可视化

可视化生命数据,支撑数据应用平台所有数据集的可视化。

计算

计算工具平台集合基因组研究领域常见易用的各种计算工具,例如BLAST。

新闻事件


  • 出生缺陷综合数据库Beta版上线

    出生缺陷综合数据库主要关注具有遗传起源的出生缺陷疾病,收集相关样本的基因型数据和表型数据,致力于促进该领域数据的共享、交流与合作。研究者可以通过检索获得特定疾病的基本信息和病例的临床信息等。

    人群多态性数据库Beta版更新

    人群多态性数据库(DHGV)收录了最大的人类遗传变异公共目录,尤其是中国人群,截至目前,该数据库已经累计收集到来自3万多人的超过2.2亿人类变异型,去冗余之后有1.2亿人类变异型。数据库将继续收集更多的人类变异型,并衷心地欢迎更多人提供自己的个人遗传变异型。

    癌症数据集成与整合分析平台V1.1更新

    癌症数据集成与整合分析平台为用户提供一个整合的平台,提供多组学数据和各种分析工具,以帮助用户分析公共数据库的数据和他们自己的数据。这些分析工具都是精心设计并易于使用的,即包括了单组学数据和单数据类型,也包括了跨组学数据和多种数据类型。

    人类共生微生物数据库V1.1更新

    人类共生微生物数据库V1.1版本,新增了菌株部分,对1443个样本数据的检索筛选功能进行了优化,可对查询结果选择关注的表型数据项,添加了数据统计可视化功能,同时提供了样本的gene profile数据路径(内部数据)。

  • cfDNA数据库Beta版上线

    cfDNA数据库收录了基于大规模高通量测序平台BGI-SEQ500的的测序数据,为在基因组层面开展可量化的游离DNA的研究提供了强大支持。数据库包含一万例样本的cfDNA检测数据及相关表型数据(内部访问),并对无创产前NIPT的数据进行了可视化展示。

    儿童肿瘤数据库Beta版上线

    儿童肿瘤数据库主要收录了北京天坛医院收集的儿童肿瘤样本表型及多组学测序数据信息,有助于儿童肿瘤的分子机制研究和临床相关的基因突变研究。

    比较基因组数据库Beta版上线

    比较基因组数据库旨在汇集地球上不同物种的知识和组学数据集,包括一些国际大项目的优秀数据集如B10K,1KITE等,构建和完善物种进化树(tree of life)和物种多样性平台以进行跨物种多维度进化比较,建立物种发育进化树以揭示物种进化关系,基于物种知识、生物数据、barcode、图片等数据构建的物种识别系统以进行物种鉴定和信息查询。

    农业多样性数据库Beta版上线

    农业多样性数据库(ADD)旨在整合当今全球范围农业领域不同科研项目产生的数据和物种信息,为相关研究者开发利用物种资源和科学研究提供便利、友好的数据交互平台。ADD的数据构成计划将包括全球植物的基因组和其它类型数据,以及部分经济动物的相关数据。目前,数据库已经整合的数据包括全部完成基因组测序的植物和部分动物的物种介绍,基因组数据,基因结构和功能注释信息。

  • 人类不孕不育与流产组织研究数据库Beta版上线

    人类不孕不育与流产组织研究数据库(HIFTD),包含了与人类生殖相关疾病的基因组测序信息,包括不孕症,反复流产,无精症,多囊卵巢综合症,子宫肌瘤,子宫内膜异位,子宫腺肌症等等。此外,本数据库也包含了流产组织和健康个体的测序及相关变异数据。人类不孕不育与流产组织数据库对临床工作者和科研工作者提供单位点多态性,小的插入和删除(小于50碱基对),拷贝数变异(包括大的插入和删除),结构变异(包括易位和倒位)。

  • 免疫数据库V1.2更新

    免疫数据库(PIRD)收录了不同表型的脊椎动物物种的免疫球蛋白(IG)和T细胞受体(TCR)的原始和分析的序列。V1.2版本不仅新增了样本及数据(目前公开1809个样本),并新增了数据的可视化分析功能,用户可提交自己的免疫组学数据与数据库数据进行比对分析,进行可视化展示,同时依托CNGB的高性能序列比对服务,提供了免疫数据库序列的BLAST序列比对功能。

  • 10KP万种植物项目数据库Beta版发布

    万种植物项目旨在对超过10000个代表植物和真核微生物的主要进化枝的基因组进行测序。该项目将在未来五年(2017-2022年)内生成大规模的植物基因组数据,解决有关植物进化的基本问题。项目主要支持单位包括深圳华大基因研究院(BGI-Shenzhen)和国家基因库(CNGB)。BGI主要应用BGISEQ平台对10KP项目样本进行测序和组装,并开发新的工具。

  • 国家基因库核酸序列归档系统(CNSA)发布

    国家基因库核酸序列归档系统(CNSA)是一个方便快捷的在线提交生物研究项目、样本、实验等信息数据的系统,致力于生物测序信息和数据的存储和共享。CNSA为全球的研究者提供当前最全面的数据和信息资源,促使研究人员能够便捷深入的访问和使用数据。

  • 单细胞数据库免费开放共享数据

    单细胞数据库(SCDB)将创建人类细胞图集,对身体中所有类型甚至亚型的细胞进行编目,构建人类细胞完整清单,定义人类细胞,构建人体细胞框架图。目前,单细胞数据库汇集并展示了单细胞项目组46个样本,30854个细胞,470G单细胞数据,该数据库免费提供数据查询下载使用共享。

    百万病原鉴定数据库(v1.0)开放免费线上服务

    病原数据库(PVD),汇聚了百万种病原微生物的基因数据及相关的注释信息,关注人源样本未知感染病原的鉴定及检测,提供全面的基因测序数据的病原鉴定功能,通过数据分析和可视化手段,一目了然的展示鉴定结果。

  • CNGB高性能序列比对服务公开测试(v1.0)

    CNGB 正在开发高性能序列搜索(比对)服务。目前公测版本是基于NCBI BLAST+ 2.6.0版本开发,已支持大部分NCBI BLAST数据库的序列比对,并逐步整合CNGB的公开数据集。下半年将会对序列搜索的并行计算方案作进一步的优化,新增高质量的数据集,并整合数据可视化功能,不断有版本更新。

  • 涵盖47万物种,v1.0版本海洋生物基因组数据库发布

    海洋生物基因组数据库(MLGD)是一个旨在对海洋生物基因组数据进行收集和分析的在线数据库平台。平台收集了当前已测序和发表的海洋生物基因组,转录组和蛋白质组数据。并将这些数据及物种的基本信息依照海洋生物分类树组织起来。每个物种的基本信息包括:物种简介,参考文献,图片信息,基因组信息和数据。目前,已收集472547个物种信息,7538份基因组数据,25514份图片信息。

  • PIRD更新

    PIRD v1.1整合了知识库,该知识库记录了导致疾病特异性的CDR3序列,以及具体的疾病和相对应的CDR3信息,为免疫疾病研究提供经验支持。