CNGBdb有哪些实用科学数据库?【生菜综合数据库】 | CNGBdb-Question Time

2023-12-20 236CNGBdb

LettuceDB是截至目前全球最大的生菜种质基因资源数据库。

CNGBdb上有哪些实用科学数据库?

生菜综合数据库

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基于生菜群体测序研究项目一期445份重测序的原始数据及相关分析结果,并整合样本种质信息,国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)构建生菜综合数据库(LettuceDB),为生菜科研与育种工作提供丰富的数字化资源。

数据资源

目前已发布的版本包括包括450份生菜资源的2亿条基因变异信息,同时提供生菜及野生近缘种的基因数据和种质信息。

主要功能

该数据库将多维数据整合为种质、基因组、变异组、表型组、微生物组和时空转录组六大模块。基因组浏览器Jbrowse包含基因注释、序列变异、区域选择和全基因组关联结果。同时还开发了一个用户友好的生物信息学工具箱,使LettuceDB成为生菜研究和育种的一站式平台。

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图片来源于LettuceDB官网

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