Fungal 28S Ribosomal RNA (LSU) RefSeq Targeted Loci Project.
Source: NCBI BioProject (ID PRJNA51803)
Source: NCBI BioProject (ID PRJNA51803)
0 0
Project name: Fungi
Description: The 28S ribosomal RNA targeted loci project is a RefSeq curated data set sourced from INSDC records. At a minimum the sequence contains the hyper variable D1/D2 region and each record contain a collection identifier (predominantly type material) from a public collection. The presence of the 28S signature has been verified by the ribovore pipeline (https://github.com/nawrockie/ribovore) using hidden Markov and covariance models. Other verification steps include checking for vector sequences, too many ambiguous nucleotides, and misassembled sequences. LSU RefSeq accessions (prefix: NG_) include sequences mostly obtained from type specimens and a few from reference specimens. Type and reference identifiers are curated by NCBI Taxonomy. The collection source of type material is indicated in each record and collection acronyms follows the collection codes maintained at https://www.ncbi.nlm.nih.gov/biocollections/. All sequences will have the same project ID and can be found as such. NCBI RefSeq Targetd Loci Project.
Data type: RefSeq Targeted Locus (Loci)
Sample scope: Multiisolate
Organization: NCBI
Literatures
- PMID: 10081586
- PMID: 10319517
- PMID: 10768474
- PMID: 10794150
- PMID: 10826826
- PMID: 10843082
- PMID: 12702266
- PMID: 13130065
- PMID: 14734035
- PMID: 15035502
- PMID: 15143054
- PMID: 15388757
- PMID: 15683926
- PMID: 15837376
- PMID: 15912941
- PMID: 16919432
- PMID: 17051209
- PMID: 17311592
- PMID: 17486963
- PMID: 17486974
- PMID: 17486977
- PMID: 17486983
- PMID: 17961172
- PMID: 18222674
- PMID: 18490983
- PMID: 18490987
- PMID: 18501579
- PMID: 18592907
- PMID: 18671746
- PMID: 18676488
- PMID: 18701267
- PMID: 18951773
- PMID: 19151324
- PMID: 19287535
- PMID: 19675967
- PMID: 19734291
- PMID: 19750945
- PMID: 19750950
- PMID: 19763872
- PMID: 19777306
- PMID: 19784794
- PMID: 20169022
- PMID: 20169030
- PMID: 20357218
- PMID: 20396576
- PMID: 20435745
- PMID: 20491937
- PMID: 20524604
- PMID: 20648753
- PMID: 20943553
- PMID: 21037034
- PMID: 21148886
- PMID: 21156562
- PMID: 21156573
- PMID: 21289106
- PMID: 21523192
- PMID: 21646215
- PMID: 21700632
- PMID: 21700641
- PMID: 22025806
- PMID: 22102902
- PMID: 22403473
- PMID: 22407501
- PMID: 22675047
- PMID: 22679598
- PMID: 22684285
- PMID: 22978764
- PMID: 23056233
- PMID: 23099513
- PMID: 23105154
- PMID: 23105156
- PMID: 23105157
- PMID: 23105159
- PMID: 23245618
- PMID: 23294425
- PMID: 23300990
- PMID: 23355966
- PMID: 23396154
- PMID: 23396723
- PMID: 23587800
- PMID: 23606762
- PMID: 23606768
- PMID: 23709484
- PMID: 23709522
- PMID: 23709524
- PMID: 23709525
- PMID: 23898410
- PMID: 23898417
- PMID: 23898419
- PMID: 24003137
- PMID: 24012303
- PMID: 24014624
- PMID: 24761037
- PMID: 23748934
- PMID: 9114410
- PMID: 9850420
- PMID: 11761369
- PMID: 11827209
- PMID: 12702293
- PMID: 12702342
- PMID: 14726245
- PMID: 15280322
- PMID: 15381126
- PMID: 15545491
- PMID: 16096688
- PMID: 17113766
- PMID: 17375365
- PMID: 17986254
- PMID: 19436126
- PMID: 19783617
- PMID: 19823938
- PMID: 20056771
- PMID: 20348317
- PMID: 20522116
- PMID: 21604098
- PMID: 22025802
- PMID: 22331449
- PMID: 22869240
- PMID: 23208204
- PMID: 24103069
- PMID: 26781375
- PMID: 7662294
- PMID: 11760962
- PMID: 12508903
- PMID: 12702358
- PMID: 12748049
- PMID: 12748053
- PMID: 12892922
- PMID: 15545492
- PMID: 15583336
- PMID: 15864759
- PMID: 16014511
- PMID: 16166736
- PMID: 16403904
- PMID: 17766453
- PMID: 17986255
- PMID: 18450725
- PMID: 18776675
- PMID: 20467812
- PMID: 21498662
- PMID: 21828013
- PMID: 23125316
- PMID: 23524351
- PMID: 23710049
- PMID: 24515269
- PMID: 26297665
- PMID: 27902197
- PMID: 10696471
- PMID: 11816982
- PMID: 16487352
- PMID: 17562216
- PMID: 18327708
- PMID: 18654040
- PMID: 19164878
- PMID: 19164880
- PMID: 19239499
- PMID: 19765089
- PMID: 19965993
- PMID: 23749284
- PMID: 25132542
- PMID: 25762773
- PMID: 26188713
- PMID: 27974086
- PMID: 28160110
- PMID: 15774693
- PMID: 16495649
- PMID: 17161485
- PMID: 17498213
- PMID: 19054122
- PMID: 19416367
- PMID: 19684309
- PMID: 23011006
- PMID: 23114573
- PMID: 23496865
- PMID: 23938285
- PMID: 25743785
- PMID: 11760960
- PMID: 11931158
- PMID: 13130067
- PMID: 15388755
- PMID: 16483756
- PMID: 16902043
- PMID: 17878663
- PMID: 18344072
- PMID: 19161556
- PMID: 19502352
- PMID: 20729311
- PMID: 20833877
- PMID: 20967499
- PMID: 21205156
- PMID: 22798647
- PMID: 23710055
- PMID: 23863289
- PMID: 24763602
- PMID: 24812367
- PMID: 19138737
- PMID: 23606771
- PMID: 5750670
- PMID: 11411691
- PMID: 12149344
- PMID: 12702459
- PMID: 15872227
- PMID: 16000456
- PMID: 19287524
- PMID: 19385997
- PMID: 20207807
- PMID: 21976765
- PMID: 22075600
- PMID: 22454494
- PMID: 23518518
- PMID: 24014900
- PMID: 27616791
- PMID: 16704653
- PMID: 20662633
- PMID: 21151560
- PMID: 24027345
- PMID: 24966363
- PMID: 25147085
- PMID: 26135866
- PMID: 15446719
- PMID: 16378718
- PMID: 18488360
- PMID: 18547823
- PMID: 19272327
- PMID: 19287523
- PMID: 19287533
- PMID: 20169021
- PMID: 20169026
- PMID: 20198145
- PMID: 20198162
- PMID: 20664761
- PMID: 20943525
- PMID: 21914826
- PMID: 22171078
- PMID: 22684288
- PMID: 22852752
- PMID: 23233513
- PMID: 23606766
- PMID: 23667144
- PMID: 23696914
- PMID: 23935025
- PMID: 24012305
- PMID: 24014902
- PMID: 24563835
- PMID: 24761040
- PMID: 24895423
- PMID: 24895429
- PMID: 24950598
- PMID: 25264382
- PMID: 25264385
- PMID: 25264390
- PMID: 25716450
- PMID: 25734030
- PMID: 25737591
- PMID: 25737601
- PMID: 26823630
- PMID: 26823634
- PMID: 26955201
- PMID: 27570325
- PMID: 27783317
- PMID: 27804952
- PMID: 28050055
- PMID: 28101893
- PMID: 28232761
- PMID: 28298348
- PMID: 28895520
- PMID: 9828447
- PMID: 10528400
- PMID: 10696468
- PMID: 12099793
- PMID: 12396494
- PMID: 12508901
- PMID: 12710634
- PMID: 14563139
- PMID: 14629392
- PMID: 14734036
- PMID: 15185979
- PMID: 15388759
- PMID: 15612623
- PMID: 15634983
- PMID: 15704288
- PMID: 15757174
- PMID: 15793619
- PMID: 15912952
- PMID: 16081324
- PMID: 16314682
- PMID: 16396346
- PMID: 16529956
- PMID: 16596954
- PMID: 16596955
- PMID: 16652205
- PMID: 16769507
- PMID: 16800306
- PMID: 16800307
- PMID: 16876699
- PMID: 17066342
- PMID: 17572335
- PMID: 17710625
- PMID: 17883030
- PMID: 18490976
- PMID: 18490993
- PMID: 18490994
- PMID: 18490995
- PMID: 18490996
- PMID: 18728073
- PMID: 18959162
- PMID: 19196790
- PMID: 19422072
- PMID: 19501162
- PMID: 19538392
- PMID: 19539759
- PMID: 19657958
- PMID: 19666804
- PMID: 20198141
- PMID: 20198158
- PMID: 20198164
- PMID: 20199897
- PMID: 20361508
- PMID: 20396579
- PMID: 20396583
- PMID: 20467485
- PMID: 20502538
- PMID: 20524592
- PMID: 20524593
- PMID: 20648762
- PMID: 20664758
- PMID: 20806005
- PMID: 20926710
- PMID: 20952544
- PMID: 20970511
- PMID: 21148858
- PMID: 21156537
- PMID: 21156572
- PMID: 21368323
- PMID: 21515705
- PMID: 21523191
- PMID: 21632407
- PMID: 21659217
- PMID: 21664282
- PMID: 21828018
- PMID: 21828215
- PMID: 22025805
- PMID: 22067304
- PMID: 22123656
- PMID: 22242007
- PMID: 22332907
- PMID: 22381457
- PMID: 22403475
- PMID: 22403481
- PMID: 22629418
- PMID: 22679570
- PMID: 22684295
- PMID: 22737101
- PMID: 22760037
- PMID: 22877646
- PMID: 23080023
- PMID: 23105158
- PMID: 23898408
- PMID: 23934252
- PMID: 24014897
- PMID: 24014898
- PMID: 24014901
- PMID: 24027346
- PMID: 24027348
- PMID: 24027349
- PMID: 24302788
- PMID: 24302789
- PMID: 24376525
- PMID: 24528638
- PMID: 24761041
- PMID: 24806455
- PMID: 24871592
- PMID: 24871596
- PMID: 24871600
- PMID: 24891412
- PMID: 24925597
- PMID: 24969729
- PMID: 25083402
- PMID: 25083414
- PMID: 25164483
- PMID: 25492987
- PMID: 25492988
- PMID: 25492990
- PMID: 25617836
- PMID: 25737593
- PMID: 25737597
- PMID: 25800251
- PMID: 25911703
- PMID: 26058537
- PMID: 26085610
- PMID: 26085612
- PMID: 26203422
- PMID: 26203427
- PMID: 26240442
- PMID: 26240451
- PMID: 26321731
- PMID: 26354808
- PMID: 26615751
- PMID: 26699541
- PMID: 26734544
- PMID: 26823626
- PMID: 26823628
- PMID: 26823636
- PMID: 26955197
- PMID: 27020153
- PMID: 27071492
- PMID: 27103850
- PMID: 27433441
- PMID: 27504028
- PMID: 27616788
- PMID: 27742091
- PMID: 27742096
- PMID: 27766001
- PMID: 27910191
- PMID: 28007214
- PMID: 28050056
- PMID: 28154479
- PMID: 28232758
- PMID: 28317538
- PMID: 28402797
- PMID: 28413236
- PMID: 28418780
- PMID: 28539687
- PMID: 28626275
- PMID: 28663602
- PMID: 28803979
- PMID: 28824846
- PMID: 28947840
- PMID: 29020509
- PMID: 29144843
- PMID: 29180830
- PMID: 29242779
- PMID: 29248113
- PMID: 29367793
- PMID: 29503478
- PMID: 29559827
- PMID: 10347022
- PMID: 11371588
- PMID: 11760963
- PMID: 11761366
- PMID: 12532015
- PMID: 12725287
- PMID: 15185975
- PMID: 15449591
- PMID: 16121568
- PMID: 16389963
- PMID: 16894969
- PMID: 17363235
- PMID: 20660211
- PMID: 20664763
- PMID: 21523188
- PMID: 21523197
- PMID: 22025808
- PMID: 22466797
- PMID: 22685364
- PMID: 23355963
- PMID: 23921243
- PMID: 24433677
- PMID: 24528639
- PMID: 24987130
- PMID: 25572100
- PMID: 25661718
- PMID: 25725001
- PMID: 25813509
- PMID: 25911694
- PMID: 26203419
- PMID: 26240304
- PMID: 26263180
- PMID: 26432805
- PMID: 26553778
- PMID: 26740546
- PMID: 27153885
- PMID: 27474519
- PMID: 27742092
- PMID: 27742094
- PMID: 28402789
- PMID: 28463625
- PMID: 28636496
- PMID: 15103235
- PMID: 16722219
- PMID: 19060091
- PMID: 20169025
- PMID: 20348316
- PMID: 20618870
- PMID: 20943504
- PMID: 21558503
- PMID: 22246589
- PMID: 22408574
- PMID: 22778168
- PMID: 23355967
- PMID: 23838443
- PMID: 24500004
- PMID: 24682701
- PMID: 26194954
- PMID: 26240448
- PMID: 26297779
- PMID: 26364292
- PMID: 26742582
- PMID: 27127212
- PMID: 27153883
- PMID: 27188884
- PMID: 27688209
- PMID: 27760848
- PMID: 9691489
- PMID: 12807220
- PMID: 15093778
- PMID: 18222081
- PMID: 21523195
- PMID: 23205556
- PMID: 23449076
- PMID: 23653119
- PMID: 24871590
- PMID: 24871608
- PMID: 24925598
- PMID: 25251413
- PMID: 26240444
- PMID: 26615743
- PMID: 10565914
- PMID: 14657150
- PMID: 15381125
- PMID: 18929650
- PMID: 19070663
- PMID: 20943137
- PMID: 21148859
- PMID: 21315315
- PMID: 21415293
- PMID: 21933922
- PMID: 21933930
- PMID: 22863989
- PMID: 22927015
- PMID: 23355700
- PMID: 23807153
- PMID: 24025910
- PMID: 24052626
- PMID: 24442819
- PMID: 24782496
- PMID: 25761862
- PMID: 26240310
- PMID: 26315030
- PMID: 26823632
- PMID: 26823633
- PMID: 27549618
- PMID: 27742095
- PMID: 27902349
- PMID: 28418787
- PMID: 28591150
- PMID: 28700638
- PMID: 28742005
- PMID: 28820103
- PMID: 12702457
- PMID: 15545490
- PMID: 15925316
- PMID: 16166735
- PMID: 22228664
- PMID: 24012299
- PMID: 24891416
- PMID: 25572096
- PMID: 26228559
- PMID: 26240301
- PMID: 26367271
- PMID: 28390506
- PMID: 15657028
- PMID: 16392255
- PMID: 19656939
- PMID: 21186327
- PMID: 21616901
- PMID: 24761038
- PMID: 25152549
- PMID: 25644481
- PMID: 26240450
- PMID: 27616795
- PMID: 27760850
- PMID: 29151634
- PMID: 29336678
- PMID: 10380650
- PMID: 23723988
- PMID: 28419220
- PMID: 24761043
- PMID: 29255336
- PMID: 29927367
- PMID: 29955203
- PMID: 30125239
- PMID: 17253980
- PMID: 17854399
- PMID: 18314317
- PMID: 18422614
- PMID: 19406825
- PMID: 21700635
- PMID: 22544789
- PMID: 23264508
- PMID: 23288485
- PMID: 23772605
- PMID: 23872280
- PMID: 25180089
- PMID: 29734727
- PMID: 26490701
- PMID: 27091385
- PMID: 27486931
- PMID: 28613149
- PMID: 29461186
- PMID: 29681738
- PMID: 29681739
- PMID: 29754318
- PMID: 29780270
- PMID: 29997447
- PMID: 30207872
- PMID: 30215573
- PMID: 30275740
- PMID: 7778898
- PMID: 21140214
- PMID: 21380505
- PMID: 22772026
- PMID: 25734027
- PMID: 27020159
- PMID: 28889913
- PMID: 29151628
- PMID: 29792588
- PMID: 30487306
- PMID: 30574012
- PMID: 30584265
- PMID: 31133992
- PMID: 31187339
- PMID: 27872508
- PMID: 27990331
- PMID: 28232766
- PMID: 28767681
- PMID: 29861654
- PMID: 30018875
- PMID: 30123029
- PMID: 30150880
- PMID: 30505003
- PMID: 30518989
- PMID: 31043854
- PMID: 29863995
- PMID: 24761036
- PMID: 26955202
- PMID: 22505431
- PMID: 22553236
- PMID: 29771641
- PMID: 14635765
- PMID: 15388758
- PMID: 19648342
- PMID: 22139457
- PMID: 22684292
- PMID: 25644482
- PMID: 31637663
- PMID: 30026668
- PMID: 30018297
- PMID: 30016423
- PMID: 31885464
- PMID: 29849476
- PMID: 31967533
- PMID: 15737582
- PMID: 27893750
- PMID: 32091968
- PMID: 25550303
- PMID: 32271133
- PMID: 26398347
- PMID: 32206025
- PMID: 30872943
- PMID: 30342626
- PMID: 31139006
- PMID: 21482626
- PMID: 26953522
- PMID: 31217724
- PMID: 30481132
- PMID: 15288074
- PMID: 17313582
- PMID: 30814906
- PMID: 30250711
- PMID: 18057818
- PMID: 30344439
- PMID: 17363232
- PMID: 14657151
- PMID: 32023268
- PMID: 32119635
- PMID: 31662619
- PMID: 29370576
- PMID: 14574108
- PMID: 22123654
- PMID: 28966419
- PMID: 20198138
- PMID: 26240445
- PMID: 29526211
- PMID: 18751543
- PMID: 30918449
- PMID: 22675045
- PMID: 27742098
- PMID: 21262986
- PMID: 24563834
- PMID: 25737594
- PMID: 25937064
- PMID: 18490978
- PMID: 23719217
- PMID: 26951037
- PMID: 16121570
- PMID: 17486980
- PMID: 22679588
- PMID: 28706324
- PMID: 18554889
- PMID: 21558498
- PMID: 26466879
- PMID: 26577612
- PMID: 32467898
- PMID: 19338635
- PMID: 16341464
- PMID: 712025
- PMID: 18065008
- PMID: 22306043
- PMID: 29913116
- PMID: 32879617
- PMID: 32357194
- PMID: 21646174
- PMID: 32742179
- PMID: 16121569
- PMID: 21439389
- PMID: 22268073
- PMID: 22353744
- PMID: 23921245
- PMID: 24271212
- PMID: 29932817
- PMID: 31048984
- PMID: 31523163
- PMID: 31900053
- PMID: 31919462
- PMID: 32412354
- PMID: 32574523
- PMID: 33006908
- PMID: 32273791
- PMID: 32315246
- PMID: 32587321
- PMID: 32714291
- PMID: 32904212
- PMID: 32924919
- PMID: 33337289
- PMID: 32547305
- PMID: 32793142
- PMID: 33175671
- PMID: 33343219
- PMID: 33540644
- PMID: 18308531
- PMID: 20198135
- PMID: 22888193
- PMID: 24372735
- PMID: 24566828
- PMID: 24633952
- PMID: 26240302
- PMID: 30543486
- PMID: 31166162
- PMID: 32134373
- PMID: 32467923
- PMID: 32733146
- PMID: 32765456
- PMID: 32774511
- PMID: 32904352
- PMID: 33117082
- PMID: 33281477
- PMID: 33319784
- PMID: 33562556
- PMID: 33646471
- PMID: 33658081
- PMID: 33677752
- PMID: 33801963
- PMID: 33810364
- PMID: 33947898
- PMID: 34124618
- PMID: 29511957
- PMID: 29792783
- PMID: 32957559
- PMID: 27558134
- PMID: 31433292
- PMID: 31551616
- PMID: 31879525
- PMID: 32821215
- PMID: 33505198
- PMID: 34393591
- PMID: 34408538
- PMID: 34594152
- PMID: 34685383
- PMID: 20943536
- PMID: 35028741
- PMID: 35032673
- PMID: 35145340
- PMID: 20198136
- PMID: 34832545
- PMID: 34833043
- PMID: 34899100
- PMID: 35049941
- PMID: 35205862
- PMID: 35482507
- PMID: 33364897
- PMID: 16018310
- PMID: 16800310
- PMID: 18938242
- PMID: 19202848
- PMID: 19624739
- PMID: 27091389
- PMID: 29020517
- PMID: 29094244
- PMID: 29293408
- PMID: 29681736
- PMID: 32206024
- PMID: 32476981
- PMID: 33327878
- PMID: 33337985
- PMID: 33945432
- PMID: 33958953
- PMID: 34110972
- PMID: 34275495
- PMID: 34475802
- PMID: 34493345
- PMID: 34720643
- PMID: 34759734
- PMID: 34829269
- PMID: 35234608
- PMID: 35330259
- PMID: 35330274
- PMID: 35437417
- PMID: 35452350
- PMID: 35628685
- PMID: 35741387
- PMID: 35887475
- PMID: 35938079
- PMID: 35966669
- PMID: 31341399
- PMID: 33643251
- PMID: 27561992
- PMID: 10747127
- PMID: 12892148
- PMID: 30814907
- PMID: 31139009
- PMID: 34575749
- PMID: 35448580
- PMID: 35495705
- PMID: 35628728
- PMID: 35736084
- PMID: 35794917
- PMID: 35832819
- PMID: 36294639
- PMID: 36294659
Last updated: 2010-08-30