青藏高原被称为“世界第三极”，具有低氧、高寒、强紫外线、食物匮乏等极端环境特征。高原特有的动物类群，比如牦牛、藏羚羊、藏野驴、高原鼢鼠、高原鼠兔等，经历了长期的自然选择，形成了独特的基因库，不仅包括动物宿主自身编码的基因，还包括共生微生物编码的数量庞大的基因库，特别是肠道微生物组编码的基因数量超过了宿主基因的至少150倍。以往的研究对青藏高原动物自身基因组有了系统的解析和认知，但是针对共生微生物组，特别是肠道微生物组仍缺乏全面且深入的研究。 　　青藏高原动物微生物组计划已经产生了至少30Tb的动物肠道微生物宏基因组数据，借助培养组、代谢组等多组学工具以及无菌动物功能验证，为理解物种在极端环境下适应和演化的组学机制提供全新的视角，也为肠道微生物物种和基因资源的挖掘、保护和可持续利用提供资源支撑和技术参考。