三位一体的育种信息大平台
推进农业遗传资源数字化,建立动植物种质资源大数据公共平台,与国家基因库合作,以种质资源库为基础,建立三位一体的核心种质基因库,为提高分子育种效率、加大种质资源和数据共享力度,打赢“种业翻身仗”提供基础支撑,建立国内外领先的作物遗传资源信息大数据平台,将库存的遗传资源真正变为公共产品。
国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)
国家基因库生命大数据平台(China National GeneBank DataBase, CNGBdb)是一个为科研社区提供生物大数据共享和应用服务的统一平台(Science as a Service),基于大数据 和云计算技术,提供数据归档、计算分析、知识搜索、管理授权和可视化等数据服务。目前CNGBdb整合了来源于国家基因库、NCBI、EBI、DDBJ等平台 的数据,包括文献、变异、基因、蛋白质、序列、项目、样本、实验、测序、组装10个结构的大量分子数据和其他信息,通过CNGBdb搜 索建立索引,并将这些数据与样本甚至样本活体相关联,从而实现数据从活体到样本再到信息数据全过程的可追溯性,达成综合数据的全贯穿。
国家基因库样本信息共享平台(EBB)
国家基因库样本信息共享平台(E-BioBank,简称EBB),致力于搭建样本持有方与使用方之间的桥梁,整合国内外生物样本信息和样本库信息,规范并统一样本信息整合标准,创造公平、公开的生物样本共享环境,促进生物样本的科学、合理利用,是一个公益性、基础性、战略性的科技创新服务平台。
国家基因库动植物资源活体库(BRC-PAM)
国家基因库动植物资源活体库可共享和分发关联基因组学数据信息的生物遗传材料,包括动物细胞系、植物种子和微生物菌株等;同时,活体库可提供细胞培养与检测、植物样本采集与鉴定、高通量培养组学与鉴定等多种标准化的技术服务。
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动物资源库
动物资源库主要以动物细胞系的形式存储物种遗传资源,具备动物细胞分离、体外培养、细胞检测和超低温存储的能力,已与国内多家机构建立合作,共同保存和保护动物物种遗传资源。目前动物资源库已成功建立并保藏了近50种动物的2000余份细胞系,同时,动物资源库还可提供细胞培养、细胞检测和样本存储等技术咨询和服务。
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植物资源库
植物资源库建立了标准的植物物种采集、保藏和鉴定技术体系,以种子、标本和叶片组织等多种形式保存和保护植物物种遗传资源。目前已成功建立近10万份的种子存储能力,采集并制作了2万余份标本和叶片分子材料,可供科研工作者使用。同时,植物资源库与斯瓦尔巴世界末日种子库、全球作物多样性信托基金、联合国粮食及农业组织、荷兰瓦格宁根大学遗传资源中心等国内外机构开展交流合作。
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微生物资源库
微生物资源库致力于微生物菌株的筛选、鉴定和保藏,已通过高通量培养组学筛选获得4.2万余株菌株,同时,完成了2000多个菌株全基因组测序,初步建立了健康人体共生微生物菌株资源库及其全基因组数据库。