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国家基因库农业数字化服务平台
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低成本、高通量的测序服务

国家基因库目前拥有世界领先的基因测序平台和存储量全国领先的数据库及相应的信息分析平台,具有Pb级的年数据产出能力。基因库读平台全部使用国产化测序仪,可为农业领域研究机构及企业提供低成本、高通量的测序服务。同时在单细胞等前沿领域,建成了标准化、自动化的单细胞测序平台,年单细胞产出能力达3000万个。2011年的3000份水稻重测序用了一年时间,大约450万元,今天,同样的工作可以用50万元在三个月内完成。基因库可为农业领域研究机构及企业提供低成本高通量的测序服务,快速将种质资源转化为种质基因数据资源,长期保存及开发利用,创建种质+基因快速育种新模式。

动植物全基因组重测序

全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行DNA测序,并在此基础上完成个体或群体分析。全基因组重测序通过序列比对,可以检测到大量变异信息,包括单核苷酸多态性(SNP)、插入缺失(InDel)、结构变异(SV)和拷贝数变异(CNV)等。基于检测到的变异能进一步研究动植物的物种特性、群体进化问题、定位目标性状基因位点。

随着测序成本降低和已知基因组序列物种的增多,全基因组重测序已经成为动植物分子育种、群体进化中最为迅速有效的方法之一。利用全基因组重测序技术有助于快速发现与动植物重要性状相关的遗传变异,应用于分子育种中,缩短育种周期。

产品优势

技术简单,稳定性好

检测变异类型丰富:可以检测SNP、InDel、SV和CNV等多种变异类型,并可用作分子标记。

高密度标记: 能够检测到全基因组范围的SNP信息,同时可检测低频SNP。

发现新的变异:与芯片方法相比较,可以检测到新的变异序列。

高性价比:与全基因组从头测序相比,耗时更短,成本更低。

转录组测序

产品介绍

转录组测序,对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序,既可以提供定量分析,检测基因表达水平差异,又可以提供结构分析,能发现稀有转录本,精确地识别可变剪切位点、基因融合等,而且不依赖于参考基因组。

技术优势

任意物种的全转录组分析:无需预先设计特异性探针,因此无需了解物种基因或基因组信息,能够直接对任何物种进行最全面的转录组分析;

覆盖度高:数字化信号,直接测定几乎所有转录本片段的序列;

检测阈值宽:跨越6个数量级的宽检测阈值,从几个到数十万个拷贝精确计数;

分辨率高:可以检测基因家族中相似基因及可变剪接造成的单碱基差异;

检测范围广:从几个到数十万个拷贝精确计数,可同时鉴定及定量正常和稀有的转录本。

单细胞测序

单细胞RNA测序技术概述

目前高通量测序技术已经深入到人类疾病、物种进化、动植物分子育种等传统的生物学研究领域中,逐渐成为一种不可或缺的研究工具。然而随着生命科学和医学基础研究的深入发展,人们发现越来越多的特殊标本和特定的生物学现象,如法医鉴定的微量标本、肿瘤内部异质性等无法用常规组织测序的方法进行研究。单细胞测序技术的出现,给这类样本的研究带来了极大的便利。

DNBelab C4 scRNA Seq 单细胞测序,基于独特的DNBelab C系列单细胞文库制备技术和强大的DNBSEQ测序技术,由DNBelab C4便携式单细胞系统、DNBelab C系列单细胞RNA文库制备套装,搭配DNBSEQ系列测序平台,以及相关的单细胞分析软件构成,可实现便捷式、即时化、一站式单细胞组学研究全流程。

研究流程

宏基因组测序

产品介绍

微生物是地球上已知种类最多、数量最大、分布最广的生物类群,仅原核微生物的总量大约就达4×1030-6×1030个。但是传统的分离培养方法限制了认识微生物世界的视野。据估计,自然环境中超过99%的微生物不能用传统的方法进行纯培养,因而也不能对它们开展依赖于纯培养的生物技术或基础方面的研究。为了克服传统纯培养技术的不足,充分挖掘此类未培养微生物所蕴涵的巨大潜能,研究者们发展了宏基因组学的研究方法。利用分子生物学的研究方法绕过纯培养技术来研究微生物的多样性及功能,提供了一种探知微生物多样性结构和功能基因组的免培养方法,是一条寻找新基因及其产物的新途径。

研究内容

宏基因组研究以环境中所有微生物基因组为研究对象,通过对环境样品中的全基因组DNA进行高通量测序,获得单个样品的饱和数据量,基于denovo组装进行微生物群落结构多样性,微生物群体基因组成及功能,特定环境相关的代谢通路等分析,从而进一步发掘和研究具有应用价值的基因及环境中微生物群落内部、微生物与环境间的相互关系。构建的环境微生物基因集,可为环境中微生物的研究、开发和利用提供基因资源库。

产品优势

性价比高: 自主测序平台,成本可控;

测序准确性高:DNBSEQ平台滚环扩增构建DNB测序文库,PCR扩增错误不会累积,高保真序列信息;

Duplication率低:DNBSEQ平台Duplication率低,同样的数据量有效数据多出3%-17%;

无index hopping担忧:DNBSEQ平台无index hopping担忧,结果更可靠;

更多测序服务,请咨询和联系:

电话:0755-33945586
邮箱:CNGBdb@cngb.org