CNGBdb
国家基因库农业数字化服务平台
首页
农业服务
核心技术
合作案例
/
农业服务

种质资源-DNA样本-基因数据三库一体的种质资源库建库服务

深圳国家基因库是为生命科学研究和生物产业创新发展提供服务的国家级科研支撑平台,在生物资源建库领域有着大量的基础建设及运营管理经验。可为农业领域研究机构和企业等提供种质-DNA-基因数据一体的种质资源库建库,从顶层设计、技术方案、服务器选型、资源库推广、到人员培训的整体解决方案。

国家基因库植物资源库

BiosalineDB:耐盐碱植物数据库

耐盐碱植物数据库, 旨在促进耐盐碱基因组学相关研究和实际应用。提供耐盐碱植物物种资源信息,植物耐盐碱相关基因组学数据和文献分类数据。其中,耐盐碱植物数据库(BiosalineDB)的子库:滩涂植物资源库,共收录了165种野生滩涂植物,并重点介绍了其形态、分布、特点、用途以及繁殖方式,同时每一物种都配有形态、生境、应用等方面的照片。用户可以通过资源库搜索框,使用中文名或拉丁名快速获取相关滩涂植物的全面信息。

MilletDB:谷子数据库

谷子数据库是基于深圳华大基因研究院和张家口市农业科学院等单位谷子基因组研究项目数据设计,该数据库创新的将谷子的表型和基因型贯穿起来,通过谷子的表型信息可以查询和检索谷子的基因型信息,通过基因型可以查到对应的表型信息。数据库的另一个特色是基于生物大数据的技术,利用数据库2000多份谷子材料,记录的40种左右的谷子表型信息,利用机器学习方法(包括K近邻,随机森林和支持向量机算法等)针对上述基因型和表型的数据建立模型。模型最终实现从品种的基因型来预测品种表型,助力于智能分子育种。

WGVD: 小麦数据库

西北农林科技大学小麦变异数据库以镜像库的方式部署在CNGBdb,包含968个小麦种质的重测序和外显子测序的数据,变异包括7,353,314 SNPs 和 1,044,400 indels,并提供了小麦群体选择信号的统计(Pi和FST)和展示。

10KP: 万种植物数据库

10,000种植物(tenKP或10KP)项目是地球生物基因组计划(EBP)的关键组成部分。10KP旨在对代表植物和真核微生物每个主要进化分支的10,000个以上的基因组进行测序。该项目将在五年内生成大规模植物基因组数据,解决有关植物进化的基本问题。

国家基因库动植物资源数据集

CNGBdb的数据资源→数据广场→植物板块也整理了多种农作物/模式植物基因数据集,如3000水稻数据集,大豆基因组数据集,玉米基因组数据集,棉花基因组数据集等,更多农业遗传资源数据请访问https://db.cngb.org/datamart/plant/。