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合作案例

生菜群体测序

国家基因库与荷兰瓦赫宁根大学合作的生菜遗传变异检测与繁种项目,双方将共同促进对于植物遗传资源在粮食和农业等方面的研究与运用,目前项目已完成了2500份生菜的测序,囊括生菜所有品种及60%育种材料。前期工作被《Nature Genetics》接收。

荷兰遗传资源中心将向深圳国家基因库共享所有已有的生菜种质资源。同时,深圳国家基因库也将利用其“三库两平台”的优势为数字化以及存储生菜种质资源、生菜遗传变异检测及繁种提供技术支持与保障。另外,最终所有的信息都将通过深圳国家基因库的平台免费共享给大众,真正实现深圳国家基因库对于基因资源“共有、共为、共享”的理念。

分子标记辅助选择和全基因组选择是目前主流的分子辅助育种方法,育种值的估计主要依赖于由传统基因芯片法筛选所获得的分子标记的效应。由于基因芯片技术只能筛选出已知的分子标记,这些分子标记无法解释所有的遗传变异,从而直接影响对目标性状表型的预测和选择,重测序的方法同时可以检测已经存在的或开发新的分子标记,从而增加了SNP的辨识度(resolution),基于这些SNP分子标记进行分子标记辅助选择或全基因组选择可以大大提高对表型预测的准确。

关于荷兰遗传资源中心

荷兰遗传资源中心(CGN)是荷兰政府的科研职能部门,对遗传多样性和鉴定农林重要物种开展相关的科学研究。同时,CGN也是DLO基金会内协助政府完成其职能的独立科研机构。CGN致力于非原生境保护、原生境保护、以及促进遗传繁殖材料的使用以支持科研与育种并使其成为生物文化遗产的一部分。此外,CGN也向荷兰政府和国际组织提供政策支持,项目涉及农林作物与家禽、家畜等。