<2020第六期课程回顾>演化树构建与新冠病毒基因组联合分析平台介绍

本期课程回放： *

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2020 CNGBdb系列公益课程开讲啦!
2020年5月28日
<第6讲>上线
课程名称：演化树构建与新冠病毒基因组联合分析平台介绍

讲师： 丁远彤，美国杜克大学生物学博士和计算机硕士，深圳华大生命科学研究院大数据科学家、战略规划主管。

课程概要

1. 演化树构建：目的/类型和常用工具
2. 新冠中的演化分析—文献示例
3. 新冠病毒基因组联合分析平台介绍和实战
4. 数据安全和隐私保护下的新计算模式

现场Q&A

1. Q：请教下平台只能计算新冠还是其他的病毒都可以？
   A：理论上是都可以的，其他物种的数据也是可以算的，但是目前平台只针对新冠做了测试，针对其他物种的分析效果如何需要大家根据具体情况做判断。

2. Q：上传的数据对大小有限制嘛？
   A：上传文件均不超过10M，演化树计算序列总数不超过1000，安全多方计算序列不超过100。

3. Q：上传的原始数据会在平台存储多久？受什么样的协议保护？使用范围如何？
   A：用户的结果数据会长期保存，原始数据取决于用户选择的保存模式，目前支持以下三种：1. 保存为私有数据：数据将保存在平台上，仅您个人可访问和计算，计算的结果可被公开访问。保存为私有数据集的数据需在多方计算授权同意后可参与多方计算，多方计算的结果可被公开访问。2. 保存为可公开计算数据：数据将保存在平台，您个人可访问下载和计算，其他用户不可下载但可以使用您的数据进行计算。（即您的数据集将出现在单方/多方计算时“额外数据集”选项中，其他用户可以选择与您的数据合并进行计算，但不能下载您的数据文件）3. 不保存：平台将不保存您的数据，您的数据仅用于本次计算，计算的结果可被公开访问。如参与多方计算则您需重新上传数据。其它相关协议可以参考用户须知：https://db.cngb.org/virus/secure_evolution/user_instructions。

4. Q：后续还会有什么迭代功能？
   A：主要会提供更多安全多方计算类算法，比如全基因组关联研究（GWAS）系列的算法。。

审核：丁远彤
图片来源：千聊直播平台页面