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简介

rank genes for characterizing groups base on scanpy.tl.rank_genes_groups

脚本
输入
任务名称变量名称类型描述
*
      main.marker
    groupbyString
      考虑的观察分组的键值
    
*
      main
    project_nameString
      项目名称
    
*
      main
    anndataFile
      输入对象格式：anndata
    
*
      main.marker
    n_genesInt
      出现在返回表中的基因数.默认为所有基因.
    
*
      main.marker
    methodString
      默认方法为“t-test',“t-test'高估每组的方差,“wilcoxon'使用wilcoxon秩和,“logreg'使用logistic回归.
    
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      main.marker
    memoryString
      任务运行的内存数量,注意1.取值范围为0.25核-32核,另外还可选48核和64,CPU必须为0.25核的整数倍;2.内存取值范围>为1GB-512GB,且内存必须为1GB的整数倍3.CPU/内存配比值必须在1:2到1:8之间
    
*
      main.marker
    dockerString
      --
    
*
      main.marker
    cpuString
      任务运行的CPU数量,注意1.取值范围为0.25核-32核,另外还可选48核和64,CPU必须为0.25核的整数倍;2.内存取值范围为1GB-512GB,且内存必须为1GB的整数倍3.CPU/内存配比值必须在1:2到1:8之间
    
输出
任务名称变量名称类型描述
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      main
    pngfileArray[File]
      通过填写 this.xxx将输出文件地址返回到对应表格 xxx 列
    
*
      main
    h5adfileFile
      通过填写 this.xxx将输出文件地址返回到对应表格 xxx 列