免疫细胞

免疫细胞是指参与免疫应答或与免疫应答相关的细胞。包括淋巴细胞、树突状细胞、单核/巨噬细胞、粒细胞、肥大细胞等。免疫细胞可以分为多种,在人体中各种免疫细胞担任着重要的角色。

单细胞工具 | 利用CellHint自动协调和整合人类细胞图谱数据集的细胞类型

摘要:2023年12月,《Cell》发表了一种基于树的预测聚类工具CellHint,用于解决数据集之间在注释分辨率和技术偏差方面的细胞类型差异。

2024-02-2182

NC | scSpaMet:用于组织系统生物学的单细胞空间代谢组学与细胞类型特异性蛋白质分析

摘要:scSpaMet框架,通过将非靶向空间代谢组学和靶向多路蛋白成像整合到单一分析流程中,对人体组织中的单个免疫细胞和癌细胞进行蛋白质-代谢组学联合分析。

2024-02-0573

单细胞工具 | SnapATAC2:快速、可扩展、多功能的单细胞组学数据分析工具

摘要:2024年1月,《Nature Methods》发表了一种非线性降维算法SnapATAC2,不仅实现了对单细胞组学数据异构性的更精确捕获,而且还确保了高效的运行时间和内存使用,随细胞数线性扩展。

2024-01-2910

热点综述 | 跨模态单细胞分析的最佳实践

摘要:近日《Nature Reviews Genetics 》发表了一篇综述文章,总结了单模态和多模态单细胞数据分析的独立基准研究,为最常见分析步骤提供全面的最佳实践工作方案。

2023-04-234037

数据存在CNGBdb,可以发哪些杂志?【J TRANSL MED】 |CNGBdb-Question Time

摘要:Journal of Translational Medicine是一本开放获取的期刊,重点关注人类实验中的信息,以优化基础科学和临床科学之间的沟通。

2023-04-193678

数据分析工具推荐 | adaptive-m6A:从RNA序列中鉴定物种特异性m6A修饰位点

摘要:近日,《Briefings in Bioinformatics》发表了一种基于注意力的深度学习方法adaptive-m6A,用于识别多个物种中的m6A位点。

2023-04-133680

Nature Methods | 空间组学数据库推荐:SODB

摘要:2023年2月,《Nature Methods》发表了一个综合性的空间组学数据库:SODB。

2023-04-111205

热点综述 | 基于人工智能的多组学分析助力癌症精准医学研究

摘要:2023年1月《Seminars in Cancer Biology》发表了一篇综述文章,全面总结了基于人工智能的多组学肿瘤分析的最新进展,重点介绍了基于人工智能的多组学技术在癌症诊断分类早期筛查反应评估和预后预测方面的应用。

2023-04-031873

Nat. Methods | COMMOT:利用最优运输进行空间转录组细胞间通讯分析

摘要:近日《Nature Methods 》发表了一种处理复杂分子相互作用和空间约束的最优运输方法:COMMOT,推断空间转录组学中的CCC。

2023-03-301005

NBT | 使用CytoSPACE对单细胞和空间转录组进行高分辨率比对

摘要:近日,《Nature Biotechnology》发表了一种将单个细胞从scRNA-seq图谱映射到空间表达谱的优化方法:CytoSPACE。

2023-03-27537

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