免疫细胞

免疫细胞是指参与免疫应答或与免疫应答相关的细胞。包括淋巴细胞、树突状细胞、单核/巨噬细胞、粒细胞、肥大细胞等。免疫细胞可以分为多种,在人体中各种免疫细胞担任着重要的角色。

热点综述 | 单细胞+空间转录组的整合分析方法总结

摘要:回顾了整合scRNA-seq与空间转录组学技术研究的尝试和努力,包括新兴的整合计算方法,并提出了有效结合当前方法的途径。

2021-07-19110

JSTA:将空间转录组原始数据转换成单细胞水平空间表达谱的专用工具

摘要:来自美国的科研团队提出了JSTA:一种利用空间转录组学数据和scRNA-seq参考数据进行细胞联合分割和细胞类型标注的新的计算方法。

2021-07-1380

综述 | 癌症相关的miRNA及其在癌症miRNA治疗中的临床应用

摘要:总结了与各种癌症病理相关的肿瘤相关miRNA及其在癌症miRNA治疗中的临床应用。

2021-07-1289

stereoscope:利用scRNA-seq和空间转录组数据对细胞类型和空间分布进行概率推断

摘要:来自瑞典的科研团队提出一种基于模型的概率方法:stereoscope,使用单细胞数据来解析空间数据中的细胞混合物。

2021-07-06145

热点综述 | 按照分析套路,梳理一下癌症研究中的scRNA-seq计算方法…

摘要:聚焦癌症研究中单细胞转录组数据的计算分析,总结了与癌症研究相关分析的计算方法,并讨论了未来计算方法发展所面临的挑战和机遇。

2021-07-05174

BayesSpace:实现更高分辨率的空间转录组分析

摘要:来自美国的科研团队开发了BayesSpace,这是一种完全贝叶斯统计方法,它使用来自空间邻域的信息来增强空间转录组数据的分辨率并进行聚类分析。

2021-06-24151

热点综述 | 高维单细胞RNA测序数据分析工具

摘要:针对scRNA-seq分析所需的不同步骤进行广泛概述,包括数据的预处理和下游分析讨论了在scRNA-seq数据分析的每个步骤中通常会遇到的挑战,并研究了为解决这些问题而开发的不同计算工具和方法,包括它们的优势和局限性还探讨了实验设计的选择如何影响下游的数据分析。

2021-06-15332

【珍藏版】热点综述 | 单细胞多组学研究怎么做?

摘要:介绍了单细胞多组学分析技术(mRNA-基因组mRNA-DNA甲基化mRNA-染色质可及性mRNA-蛋白质)以及单细胞多组学数据的综合分析方法。

2021-05-183339

从全标本到单细胞空间组,基因表达实现“3D”分析 | 空间组学技术综述

摘要:此综述探讨了目前用于阐明空间表达的技术,解释了准确地定量捕捉空间基因表达数据的能力。

2021-05-063240

STUtility:一个为空间转录组学数据提供全流程分析的工具

摘要:一个为空间转录组学数据提供完整工作流程的工具,从测序和图像数据处理到组织的最终三维模型的创建。

2021-04-233392

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