科普

GATK

GATK 是 Genome Analysis ToolKit 的缩写,是一款从高通量测序数据中分析变异信息的软件,是目前最主流的snp calling 软件之一。

「R」统计检验函数汇总

摘要:本文基本囊括了常用的统计检验在 R 中的实现函数和使用方法。

2020-01-19122

如何从Hi-C数据中快速分析影响疾病的DNA结构?

摘要:最近,来自宾夕法尼亚州立大学的研究人员在《Genome Biology》杂志发表了其开发的一种快速定位并帮助阐明TADs复杂功能的新算法:OnTAD。

2020-01-1598

「R」数据可视化5:PCA和PCoA图

摘要:宏基因组分析中常见的PCA和PCoA图怎么画?

2020-01-13133

「R」数据可视化4: 金字塔图和偏差图

摘要:如何做差异“条形图”?

2020-01-06120

「R」数据可视化3 : 热图

摘要:热图怎么做?

2019-12-30189

「R」数据可视化2 : 箱形图

摘要:箱形图主要用于反映原始数据分布的特征,并且可以进行多组数据分布特征的比较。它能显示出一组数据的最大值(Maximum)最小值(Minimum)中位数(Median)及上下四分位数(1st/3rd Quartile)。

2019-12-23163

「R」数据可视化1: 火山图

摘要:火山图是大家在文章中经常见到的图,特别是在展示差异表达基因的时候,常常出现在芯片测序等组学检测技术的结果中。

2019-12-16122

RNA-seq数据不仅仅是表达量

摘要:还可以分析差异转录本,可变剪切,融合基因

2019-12-02182

UpSetR 高级参数使用教程

摘要:今天我们来学习一下 UpSetR 的 queries 和 attribute.plots 这两个高级参数的使用。

2019-11-18104

生存分析就是一个任人打扮的小姑凉

摘要:生存分析可以随心所欲根据表达量分组吗

2019-11-11204

请输入一个小于等于总页码数的正整数