儿童ARTIs

多发急性呼吸道感染(ARTIs)是全世界5岁以下儿童发病和死亡的最常见原因,估计每年有400万儿童死亡。

BRIEF FUNCT GENOMICS | 基因组学研究常用在线资源合集

2024年7月《Briefings in Functional Genomics》发表综述文章,概述了人类基因组学研究中使用率较高的50多种在线资源。

2024-09-11182

肿瘤研究工具 | PERCEPTION:利用肿瘤单细胞转录组学预测患者对治疗的反应和耐药性

PERCEPTION(PERsonalized Single-Cell Expression-Based Planning for Treatments In ONcology,基于单细胞表达的肿瘤精准治疗规划)。

2024-09-0271

scHiCyclePred:利用多尺度交互信息从单细胞 Hi-C 数据中预测细胞周期阶段

2024年7月,《Communications Biology》发表了一个预测模型 scHiCyclePred,其整合了多种特征集,利用 scHi-C 数据来预测细胞周期阶段。

2024-08-2648

NC | DNA甲基化去卷积方法的基准测试

2024年5月,《Nature Communications》发表综述评估了16种去卷积算法。

2024-08-1948

NC | SANTO:一种coarse-to-fine的空间组学对齐和整合方法

2024年7月,《Nature Communications》发表了一种coarse-to-fine的方法SANTO,专门针对空间组学数据的对齐和整合任务。

2024-08-1445

NC | MAGinator能够准确地分析种水平从头组装的MAGs

2024年7月,《Nature Communications》发表了一个专为分析鸟枪法宏基因组学数据集而定制的工具MAGinator,提供亚种级微生物的从头鉴定和宏基因组组装基因组(MAG)的准确丰度估计。

2024-08-0544

单细胞工具 | SCENT:从多模态单细胞数据中识别组织特异性增强子-基因图谱,找出致病等位基因

2024年4月,《Nature Genetics》发表了一种非参数统计方法SCENT(单细胞增强子目标基因图谱),其能在scRNA-seq或snRNA-seq和scATAC-seq数据中模拟增强子染色质可及性与基因表达之间的关联。

2024-07-2934

时空组工具 | 使用 scCube 模拟空间转录组中的多种变异

近日,《Nature Communications》发表了一个用于独立可重复和技术多样化的 SRT 数据模拟的 Python 包scCube,其不仅可以在基于参考的模拟中保留基因的空间表达模式,还可以在无参考的模拟中生成具有不同空间变异性的模拟数据。

2024-07-2231

NC | ezSingleCell:一站式单细胞和空间组学综合分析平台

近日《Nature Communications》发表了一款交互式且易于使用的应用程序ezSingleCell,无需事先具备编程知识即可分析各种单细胞和空间组学数据类型。

2024-07-1530

时空组工具 | 用SpatialGlue从空间多组学中解析空间域

近日,《Nature Methods》发表了一种名为SpatialGlue的新方法,该方法基于图神经网络,通过双重注意力机制,首次成功整合了小鼠脾脏胸腺和大脑的空间多组学数据。

2024-07-0827

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