COVID-19研究进展速览【2.22-2.28】| 一周精选

2020-05-12 72文献解读

每周一CNGBdb为您精选COVID-19一周研究速览!

标题:SARS-CoV-2进入细胞依赖于ACE2和TMPRSS2,一种经过临床验证的TMPRSS2抑制剂可阻断SARS-CoV-2进入细胞
期刊:Cell
DOI:10.1016/j.cell.2020.02.052
摘要:最近新型致病性SARS-CoV-2病毒在中国的出现及其在国内/国际上的迅速传播构成了全球卫生突发事件。冠状病毒进入细胞依赖于病毒S蛋白与宿主细胞受体结合,同时S蛋白被细胞蛋白酶启动。阐明SARS-CoV-2利用哪些细胞因子进入宿主细胞可能为了解病毒传播和揭示治疗靶点提供思路。本次研究,我们证明了SARS-CoV-2使用SARS-CoV受体ACE2进入细胞,而丝氨酸蛋白酶TMPRSS2用于S蛋白启动。经批准用于临床的TMPRSS2抑制剂可阻断SARS-CoV-2进入细胞,可能成为一种治疗方案。最后,我们证明了恢复期SARS患者的血清交叉中和了SARS-2 S蛋白驱动的细胞进入。我们的结果揭示了SARS-CoV-2和SARS-CoV感染之间的重要共性,并确定了抗病毒干预的潜在靶点。
特别说明:这篇文章虽然已经得到了同行评议,并已被《cell》接收,但还没有完成最终的校对工作,文中可能存在一些细节上的错误。为了让研究结果尽早公布,cell已在线发布此文:https://marlin-prod.literatumonline.com/pb-assets/journals/research/cell/CELL_S0092-8674%2820%2930229-4.pdf。

标题:SARS-CoV-2和其他B谱系β冠状病毒使用受体进入细胞的功能评估
期刊:Nature Microbiology
DOI:https://xs.scihub.ltd/https://doi.org/10.1038/s41564-020-0688-y 摘要:在过去的20年里,一些冠状病毒已经跨越物种屏障进入人类,导致严重而且往往是致命的呼吸系统疾病的爆发。自从SARS-CoV在动物市场首次被发现以来,全球病毒学项目已经在不同的动物和地理区域发现了数千种冠状病毒序列。不幸的是,对于这些病毒感染人类的能力进行功能性测试的工具很少,这严重阻碍了预测下一次人畜共患病毒爆发的努力。本次研究,我们开发了一种方法来快速筛选B谱系β冠状病毒,例如SARS-CoV和最近的SARS-CoV-2,以了解受体的使用情况及其感染不同物种细胞类型的能力。我们发现,在几种B谱系病毒进入细胞过程中宿主蛋白酶是一个重要屏障,绕过这一屏障可使几种B谱系病毒通过未知受体进入人类细胞。我们还证实了不同的B谱系病毒如何重组进入人类细胞,并确认人类ACE2是最近出现的SARS-CoV-2的受体。

标题:新型冠状病毒(2019-nCoV/SARS-CoV-2)受体ACE2在不同人群中的遗传比较分析
期刊:Cell Discovery
DOI:https://xs.scihub.ltd/https://doi.org/10.1038/s41421-020-0147-1
主要结论:综上所述,我们利用GTEx数据库系统分析了ACE2和eQTL的编码区变异,这些变异可能影响ACE2的表达,比较了不同群体ACE2的基因组特征。数据表明,尚无直接证据支持不同人群中存在抵抗冠状病毒S蛋白结合的ACE2突变体。遗传变异的分布及其等位基因频率(AFs)数据可能有助于ACE2 的进一步功能研究,包括ACE2在急性肺损伤和肺功能中的作用。东亚人群中ACE2 相关eQTL变异具有更高的AFs,这可能提示不同人群在类似条件下对2019-nCoV/COVID-19存在不同易感性或不同的感染后反应。

标题:中国爆发2019冠状病毒病(COVID-19)的特点和重要教训:中国疾病预防控制中心72314例报告摘要
期刊:JAMA
DOI:10.1001/jama.2020.2648
COVID-19爆发的流行病学特征:在72314例病例记录中,44672例为确诊病例(62%;基于咽拭子样本病毒核酸检测阳性的诊断),疑似病例16186例(22%;仅根据症状和暴露史进行诊断,未进行核酸检测),10567例为临床诊断病例(15%;该名称仅在湖北省使用;在这些病例中,没有进行核酸检测,根据与新冠肺炎相一致的症状、暴露史和肺部影像学特征做出诊断),无症状病例889例(1%;病毒核酸检测阳性,无发热、干咳、疲劳等典型症状)。大多数患者年龄在30至79岁之间(87%),大多数病例为轻症(81%;即非肺炎和轻度肺炎),总体病死率为2.3%,其中80岁以上的人群病死率为14.8%,特别严重的患者病死率为49.0%。

预印本

预印本网站:medRxiv
标题:COVID-19相关性肝损害的临床特点
主要内容:首次分析COVID-19患者相关肝损伤的临床特征,以及临床用药与肝损伤之间的关系。
DOI: https://doi.org/10.1101/2020.02.26.20026971

预印本网站:Preprint.org
标题:COVID-19的临床、实验室和影像学特征:系统回顾和荟萃分析
主要内容:从检索到的660篇文章中,经过筛选对27篇文章全文评价,19个样本定性和定量分析,39篇病例报告文章单独分析,提炼出新冠肺炎最主要的临床、生物学和影像学特征。
DOI: 10.20944/preprints202002.0378.v1

预印本网站:medRxiv
标题:基于逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)技术的诊断平台:iLACO对COVID-19冠状病毒进行快速比色检测
主要内容:开发出一种经过优化的、基于RT-LAMP的新冠病毒检测方法:iLACO(isothermal LAMP based method forCOVID-19)并对其进行了验证。
DOI: https://doi.org/10.1101/2020.02.20.20025874

预印本网站:medRxiv
标题:城市气温变化与COVID-19传播的显著相关性研究
主要内容:研究人员通过统计各地确诊人数和对应节点的气温,首次提出新冠肺炎的爆发与气候之间存在密切关系,提示病毒的传播存在最适温度。
DOI: https://doi.org/10.1101/2020.02.22.20025791

预印本网站:Preprint.org
标题:关于COVID-19有两类人需要注意
主要内容:研究人员通过大数据分析发现脂肪组织和5种癌症组织中ACE2表达量比肺部更高,提示肥胖人群和特定种类癌症更具新冠病毒的易感性,对这些人群作出重点保护将是防疫工作的关键环节。
DOI: 10.20944/preprints202002.0315.v1

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参考文献:
[1] Markus Hoffmann et al., (2020), SARS-CoV-2 cell entry depends on ACE2 and TMPRSS2 and is blocked by a clinically-proven protease inhibitor, Cell, DOI: 10.1016/j.cell.2020.02.052.
[2] Letko M, Marzi A, Munster V. Functional assessment of cell entry and receptor usage for SARS-CoV-2 and other lineage B betacoronaviruses[J]. Nature Microbiology, 2020: 1-8.
[3] Cao Y, Li L, Feng Z, et al. Comparative genetic analysis of the novel coronavirus (2019-nCoV/SARS-CoV-2) receptor ACE2 in different populations[J]. Cell Discovery, 2020, 6(1): 1-4.
[4] Wu Z, McGoogan J M. Characteristics of and Important Lessons From the Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Outbreak in China: Summary of a Report of 72 314 Cases From the Chinese Center for Disease Control and Prevention[J]. JAMA.
[5] Rodriguez-Morales, et al. Clinical, Laboratory and Imaging Features of COVID-19: A Systematic Review and Meta-analysis. Preprint. 25 Feb, 2020.
[6] Lin Yu,et alRapid colorimetric detection of COVID-19 coronavirus using a reverse transcriptional-loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) diagnostic platform:iLACO.medRxiv.24 Feb, 2020.
[7] Mao Wang, et al. Temperature significant change COVID-19 Transmission in 429 cities. MedRxiv. 25 Feb, 2020.[8] Jia, X., et al. Two Things about COVID-19 Might Need Attention. Preprints. 23 Feb, 2020.
[8] Zhenyu Fan, et al.Clinical Features of COVID-19 Related Liver Damage.MedRxiv. 28 Feb, 2020.
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