COVID-19研究进展速览【3.7-3.13】| 一周精选

2020-05-12 913文献解读

CNGBdb为您,精选COVID-19一周研究速览

标题:COVID-19对已存在消化系统疾病患者的影响
期刊:The Lancet Gastroenterology & Hepatology
DOI:https://doi.org/10.1016/S2468-1253(20)30076-5
主要内容:COVID-19对既往消化系统疾病患者的治疗具有影响。COVID-19患者的合并症及合并症数量与预后较差相关。自COVID-19暴发以来,中国已实施多项策略以降低IBD患者感染SARS-CoV-2的潜在风险。目前,需要进一步分析中国卫健委建立的COVID-19队列中的数据,更准确地确定IBD等消化道疾病患者感染SARS-CoV-2的风险、COVID-19患者合并的消化系统疾病谱及其对COVID-19治疗和预后的影响。在中国诊治患有合并症的COVID-19患者的诊疗数据和经验将为全球范围COVID-19患者的治疗提供重要参考价值。

标题:序列同源性和生物信息学方法可以预测对SARS-CoV-2免疫反应的候选靶点
期刊:Cell Host & Microbe
DOI:10.1016/j.chom.2020.03.002
摘要:应对2019年新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的出现和迅速蔓延的有效措施,需要数据和工具的开发,以了解和监测其传播和对其的免疫反应。然而,关于SARS-CoV-2的免疫反应靶点信息却很少。我们使用免疫表位数据库与分析资源(IEDB)汇集的与冠状病毒相关的可用数据,其中大部分表位来源于β-冠状病毒,尤其是SARS-CoV。SARS-CoV是与SARS-CoV-2最相似的病毒,现有研究已发现SARS-CoV在感染人类时的多个抗原表位。我们在SARS-CoV-2中发现了多个与SARS-CoV病毒高度同源的特异区域, SARS-CoV-2与SARS-CoV的多数B细胞与T细胞表位高度保守,这种蛋白区域的保守性提示两种病毒在结构与功能上的约束性。以这些保守的表位序列为靶标而设计的疫苗将有助于预防β-冠状病毒感染和对抗新型病毒。

*特别说明:这篇文章虽然已经得到了同行评议,并已被《Cell Host & Microbe》接收,但还没有完成最终的校对工作,文中可能存在一些细节上的错误。为了让研究结果尽早公布,已在线发布此文:https://marlin-prod.literatumonline.com/pb-assets/journals/research/cell-host-microbe/PDFs/CHOM_2264_S50.pdf。

标题:根据公开报道确诊病例数据评估预测COVID-19潜伏期
期刊:Annals of Internal Medicine
DOI:10.7326/M20-0504
摘要:
背景:2019年12月,一种新型人类冠状病毒SARS-CoV-2在中国被发现。对其许多关键流行病学特征的支持有限,包括临床疾病潜伏期(COVID-19),这对监测和控制活动具有重要意义。
目的:估计COVID-19潜伏期的长短,并说明其对公众健康的影响。
研究思路:汇总分析2020年1月4日至2020年2月24日期间报告的COVID-19确诊病例。 测量指标:人口统计特征及可能接触、症状出现、发热和住院时间数据。
结果:有181例确诊病例具有可识别的暴露史和症状出现时间信息,以估计COVID-19的潜伏期。中位潜伏期估计为5.1天,97.5%的人于感染后11.5天内出现症状。这些估计表明,在保守的假设下,每10000例中有101例在经过14天的主动监测或隔离后出现症状。
局限性:公开报道的病例可能代表严重病例,其潜伏期可能不同于轻度病例。
结论:这项工作为COVID-19的中位潜伏期提供了新的证据,潜伏期大约为5天,类似于SARS。我们的研究结果支持目前关于对可能接触SARS-CoV-2的人进行隔离或积极监测的建议,尽管对极端个例延长监测时间可能更合理。

标题:不同类型临床标本中SARS-CoV-2的检测
期刊:JAMA
DOI:10.1001/jama.2020.3786
主要结论:在本研究中,从205例COVID-19患者的多个部位的标本中检测出了SARS-CoV-2,其中下呼吸道标本的病毒检测结果最常为阳性。重要的是,在粪便中发现了活病毒,这意味着SARS-CoV-2可能是通过粪便途径传播的。一小部分血液样本的PCR检测结果呈阳性,表明感染有时可能是全身性的。病毒通过呼吸道和呼吸道外途径传播可能有助于解释疾病的迅速传播。

预印本

预印本网站:preprints.org
标题:血清学检测是RNA检测的一种有效补充,可用于SARS-CoV-2感染的确诊
主要结论:病毒RNA检测与血清学检测相结合,既能提高诊断的敏感性,又能保持较高的特异性。SARS-CoV-2特异性血清检测对临床实践和公共卫生具有重要价值。
DOI: 10.20944/preprints202003.0184.v1

预印本网站:bioRxiv
标题:针对DHODH(新嘧啶生物合成中的限速酶)的新型有效抑制剂是针对RNA病毒(包括新出现的冠状病毒SARS-CoV-2)的广谱抗病毒药物
主要结论:本次研究自行设计的候选药物(S312和S416)和具有抗病毒和免疫抑制双重作用的旧药物(来氟米特/特氟米特)可能不仅对流感有临床潜力,而且对在世界范围内传播的COVID-19也有临床潜力,无论这些病毒是否突变。
DOI: https://doi.org/10.1101/2020.03.11.983056

预印本网站:medRxiv
标题:与SARS-CoV-1相比,HCoV-19 (SARS-CoV-2)的气溶胶和表面稳定性
主要内容:研究人员使用雾化器设备将新型冠状病毒的样本放到空气中,模仿被感染者咳嗽或以其他方式使病毒传播的情况。新型冠状病毒可以在空气中存活数小时,在某些表面上存活两到三天。
DOI: https://doi.org/10.1101/2020.03.09.20033217

预印本网站:bioRxiv
标题:LY6E破坏冠状病毒融合,有效限制病毒感染引发的疾病
主要结论:LY6E有效地限制了由多个冠状病毒引起的细胞感染,包括SARS-CoV,SARS-CoV-2和中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)。机理研究表明,LY6E通过干扰Spike蛋白介导的膜融合抑制冠状病毒进入细胞。
DOI: https://doi.org/10.1101/2020.03.05.979260

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参考文献:
[1] https://www.thelancet.com/journals/langas/article/PIIS2468-1253(20)30076-5.
[2] Alba Grifoni,et al.A sequence homology and bioinformatic approach can predict candidate targets for immune responses to SARS-CoV-2[J]. Cell Host & Microbe.
[3] Lauer S A, Grantz K H, Bi Q, et al. The Incubation Period of Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) From Publicly Reported Confirmed Cases: Estimation and Application[J]. Annals of Internal Medicine.
[4] https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2762997.
[5] Ningshao Xia et al. Serological test is an efficient supplement of RNA detection for confirmation of SARS-CoV-2 infection. Preprints. 10 March, 2020.
[6] Rui Xiong, et al.Novel and potent inhibitors targeting DHODH, a rate-limiting enzyme in de novo pyrimidine biosynthesis, are broad-spectrum antiviral against RNA viruses including newly emerged coronavirus SARS-CoV-2.bioRxiv. 12 March, 2020. [7] Neeltje van Doremalen et al. Aerosol and surface stability of HCoV-19 (SARS-CoV-2) compared to SARS-CoV-1. medRxiv . 13 March, 2020. [8] Stephanie Pfaender et al.LY6E impairs coronavirus fusion and confers immune control of viral disease.bioRxiv. 7 March, 2020.
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