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鲎(hou)知后觉:被吃到“濒危”的除了小龙虾,还有它…

2019-11-26 59文献解读

龟鼋鳌鳖鲎,你能读出几个字?尐尐呅大胆猜测,大多数人只认识第一个字,一小部分人还认识后三个。

今天我们要聊的濒危小可怜,就是最后那个鲎[hòu],很多盆友一定很纳闷:我甚至都没见过它? 那玩意儿居然能吃?我都没吃过,它咋就濒危了?

鲎:比恐龙还古老

鲎,世界上最古老的的动物之一,虽然鲎没有猛犸象古老,但是它也是比恐龙还古老的生物,距今已经有4.5亿年历史,并且一只保持自己原有的模样。

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不羁且屌丝的外表下,鲎拥有蓝色的血液,是地球上唯一的蓝血海洋生物,上世纪50年代,还发现这种蓝色血液可以制作成重要的细菌检测剂。

中国鲎:濒危

经历了多次物种大灭绝的考验,目前世界上还有四种鲎:美洲鲎(Limulus polyphemus)、南方鲎(Tachypleus gigas)、圆尾鲎(Carcinoscorpius rotundicauda)、中国鲎(Tachypleus tridentatus)。

今年3月,中国鲎(Tachypleus tridentatus),在世界自然保护联盟(IUCN)红色名录里的等级从原本的数据缺乏(DD),更新为濒危(EN)。

可能是由于鲎蓝色血液的医用价值及民间传说的“食补”价值(清热解毒之类),导致其被无序和过度利用,导致中国鲎的野外种群数量持续下降。

保护从了解做起

对于鲎的保护,除了坚守拒食、拒售的原则,科学家们对鲎的生物、生态、遗传等方面还需不断研究,才能收集更多的数据为制定有效的保护策略提供依据。

浙江海洋大学、西北工业大学联合华大基因完成了鲎染色体水平高质量基因组组装图谱,并揭示了其进化及适应性遗传机制,为中国鲎的保护策略提供参考。此项研究发表在《Molecular Ecology Resources》杂志。

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该研究使用鲎(horseshoe crabs)的Hi-C测序数据(305.10 Gb)构建了首个染色体水平(含13条染色体)的组装图谱。染色体数量与该物种核型一致,表明该研究已将该物种基因组成功组装至染色体水平。并且BUSCO和比对率测试显示该组装图谱为鲎的高质量参考基因组,优于此前发布的版本。

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鲎,又叫马蹄蟹,可是它与蟹毫无关系,与蜘蛛、蝎子是同类。该研究在8个物种(含鲎)中进行了进化树分析,使用了772个单拷贝基因,肢口纲和蛛形纲的祖先在进化上的分离时间大概是6亿年以前(MYA),马蹄蟹与蜘蛛(Parasteatoda tepidariorum)和蝎子(Centruroides sculpturatus)在进化上的分离时间大概是493.9 亿年以前(MYA),这表明马蹄蟹是比较古老的节肢动物。基因家族分析表明2,534 和 2,859 基因家族在鲎物种中发生了扩张和收缩。

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根据从9个组织的27个转录组样本进行比较分析,发现扩张的Dscam基因位于免疫网络的关键枢纽位置。此外,Dscam基因与参与凝血级联反应的核心免疫基因凝血因子B的表达呈正相关。Dscam基因的扩增和表达所赋予的高效、特异的免疫能力可能是鲎在5亿年内具有较强环境适应性的一个因素。

本次研究中中国鲎的组装数据已保存在国家基因库生命大数据平台(CNGBdb),项目编号:CNP0000111。

参考文献
Gong L, Fan G, Ren Y, et al. Chromosomal level reference genome of Tachypleus tridentatus provides insights into evolution and adaptation of horseshoe crabs[J]. Molecular ecology resources, 2019, 19(3): 744-756.

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