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免费微课 | 打开微生物世界的秘钥:宏基因组技术

2019-07-25 686课程宏基因组技术

这是CNGBdb携手各领域一线科研工作者开讲组学系列课程『第四期』

题目:打开微生物世界的秘钥『宏基因组技术』

直播时间:2019/7/25 19:30-21:00

报名方式:

  1. 关注『国家基因库大数据平台』公众号
  2. 公众号后台回复『微课』添加听课君微信
  3. 加入CNGBdb听课群,即报名成功

课程梗概

宏基因组,一个自带“跨界体质”的神奇技术,应用领域从环境生态一路杀入医学诊断,成为病原微生物诊断新风口;其数据挖掘可以从生物多样性分析到未知蛋白结构预测...本期课程将从实验到分析,向您全面介绍宏基因组技术。

  1. 什么是生态学?为什么要研究微生物生态?
  2. 测序+微生物生态=宏基因组
  3. 如何开展宏基因组项目:实验、计算、分析

课前准备

  1. 直播形式:语音+文字+图片
  2. 课程时长:直播(90分钟);计划60分钟专家讲解 +30分钟学员提问
  3. 讲师直播中会用到CNGBdb部分功能,建议大家提前登陆注册(点击阅读原文或长按文末二维码进入CNGBdb官网)

课后练习

MGISEQ 2000
PE200 真菌ITS1
利用Snakemake搭建分析流程:https://snakemake.readthedocs.io/en/stable/
练习下载地址:ftp://ftp.cngb.org/pub/course/wexin_course/Meta_genomics/
运行方式:
snakemake –s snakefile_amplicon_pe –n
snakemake –s snakefile_amplicon_pe –j 8

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