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T细胞受体库:为自身免疫性疾病提供新靶标

2019-07-01 35文献解读免疫组库

华大基因、国家基因库联合中南大学湘雅第二医院构建了一个大型的T细胞受体(TCR)库,并对其进行了最全面的定量分析,研究发现TCR库的特征,特别是与疾病相关的克隆,可作为生物学标志物为自身免疫性疾病的疾病状态和治疗靶点提供新的见解。此项研究在国际著名免疫学期刊《Ann Rheum Dis》上发表。

研究背景

T细胞在系统性红斑狼疮(SLE)和类风湿关节炎(RA)等自身免疫性疾病中起着重要作用,在SLE和RA患者的外周血和各种器官中均发现了自身反应性T细胞。

TCR的多样性是由可变区(V)、多变区(D)、结合区(J)的基因重排以及回文和随机核苷酸的添加所产生,其对理解健康和疾病中的适应性免疫至关重要。

然而过往的研究由于技术和样本数限制,虽然在小样本量的SLE和RA患者中证实了TCR多样性的减少,但TCR序列或克隆否可作为SLE或RA的生物标志物尚不清楚。

研究结果

本次研究我们构建了一个大型的TCR库,包括877名SLE患者、206名RA患者和439名健康对照组(HC)的数据,并且对TCR的β链进行了最全面的定量分析。


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研究结论

发现SLE或RA与HC组在V、J和V-J方面存在显著差异,并利用V和V-J基因建立了一个随机森林模型,对SLE、RA和HC进行分类,准确率非常高。

鉴定了198个SLE相关和53个RA相关TCR克隆,它们具有很高的特异性和敏感性,可以区分SLE、RA和HC,发现疾病相关克隆与临床特征相关。

本次研究有助于了解SLE和RA的免疫学病因和临床异质性,为SLE和RA的诊断提供生物标志物和疾病治疗的靶点。

研究数据

本次研究中所有的数据均保存在国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)免疫数据库中,项目编号P18081001,P18081101 和P18080801。CNGBdb免疫数据库是全球最大的免疫组库。

参考文献:
Liu X, Zhang W, Zhao M, et al. T cell receptor β repertoires as novel diagnostic markers for systemic lupus erythematosus and rheumatoid arthritis[J]. Annals of the rheumatic diseases, 2019: annrheumdis-2019-215442.

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