2019-08-28 2226癌症
为了最大限度的提高治愈率,非转移性癌症患者通常采用多种治疗方式,包括术前全身治疗、手术和放疗以及术后治疗。然而,对于一些患者来说,这导致了过度治疗和不良反应,而他们本可以用更少的治疗方式治愈,而且每种连续治疗方式的益处并不确定。
如何避免癌症过度治疗?是否存在一种生物标志物可以区分残留病灶和病理完全缓解(pathCR)呢?
ctDNA,循环肿瘤DNA,从名字就可以很容易理解它来源于肿瘤细胞。ctDNA携带了肿瘤细胞的基因信息,通过液体活检技术就可以通过分析这些信息,对肿瘤进行诊断及预后监测。
目前ctDNA主要的应用集中在复发监测上,对治疗期间残留病灶检测的准确性研究有限,且非转移性癌症患者,例如乳腺癌,90%的患者在新辅助治疗期间无法检测到ctDNA,于是为了防止复发常常会使用“一刀切”式的过度治疗。
血液中的ctDNA非常微量,但是为了区分残留病灶和病理完全缓解,避免过度治疗,如何增加对ctDNA检测的灵敏度?
来自美国梅奥诊所(Mayo Clinic)及希望之城转化基因组学研究所(TGen)联合开发出一种名为“TARDIS”(TARgeted DIgital Sequencing)的新型乳腺癌液体活检方法。
TARDIS在目前临床相关血容量ctDNA检测的极限基础上,实现了100倍以上的改进,证明了个性化的ctDNA追踪可以实现对癌症患者的个体化临床管理。
TARDIS结合了基于pcr(最小化模板DNA分子的损失)和基于连接(合并UMIs、保存片段大小和数百倍多路复用)的方法优点,整合分析每位患者的数十种突变,而不是单一突变。
在参考样本中,TARDIS同时分析了8-16个已知突变,其突变等位基因比率(AF)分别达到了91%和53%的灵敏度,同时还检测到了数十到数百个深度覆盖的特异性突变。
进一步分析来自33名患有I~III期乳腺癌女性患者80份血浆样本中的115个突变。在治疗前,TARDIS在所有患者中检测到ctDNA,中位AF为0.11%。新辅助治疗完成后,获得病理完全缓解患者的ctDNA浓度低于残留病灶患者(中位AF分别为0.003%和0.017%,P=0.0057,AUC=0.83)。此外,在新辅助治疗期间,病理完全缓解患者的ctDNA浓度有较大的下降。这些结果表明,使用ctDNA分析评估新辅助治疗期间的分子反应和残留病灶具有较高的准确性。
研究人员表示,经过进一步的临床试验与验证,TARDIS将有望被常规应用于乳腺癌治疗期间的患者监测,帮助发现患者确定何时基本治愈癌症。
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McDonald B R, Contente-Cuomo T, Sammut S J, et al. Personalized circulating tumor DNA analysis to detect residual disease after neoadjuvant therapy in breast cancer[J]. Science Translational Medicine, 2019, 11(504): eaax7392.
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