1万名癌症患者的p53突变使人们对该基因的功能有了新的认识

2020-12-02 781基因相关

1万名癌症患者的p53突变使人们对该基因的功能有了新的认识。作为癌症中研究最广泛的基因之一,TP53以其作为肿瘤抑制剂的作用而闻名。它能感知细胞压力或损伤,并作出反应,停止细胞分裂或启动细胞死亡,从而阻止受损细胞繁殖。该基因的突变消除了一个关键的细胞故障安全机制,是导致癌症的一步。贝勒医学院的研究人员对TP53突变进行了最全面的研究,以更好地了解导致这一重要基因失活的过程。他们的研究结果发表在《细胞报告》杂志上,阐明了该基因如何发生突变,以及这些突变如何帮助预测临床前景。

1万名癌症患者的p53突变使人们对该基因的功能有了新的认识

由贝勒医学院分子病毒学和微生物学教授Larry Donehower博士领导的研究小组,研究了来自32种不同癌症的10225个患者样本,来自癌症基因组图谱,并与索邦大学分子生物学教授Thierry Soussi博士30年来收集的数据库中的另外8万个突变进行比较。在分析了这个庞大的数据样本后,他们对TP53基因突变如何影响癌症有了更透彻的了解。

研究小组发现,在所有研究的癌症类型中,TP53突变在生存率较差的患者中更为常见。但他们也发现了一种更准确预测预后的方法。Donehower说,他在突变的TP53肿瘤中发现了四个上调基因,它们的表达与患者的结果相关。

"如果你有这四个基因的高表达,你有一个更有可能预后不好的病人,"贝勒Dan L Duncan癌症中心的成员Donehower说。"相反,如果该患者的这些基因表达量很低,他可能会存活更久,预后良好。它会给你一个更好的画面,比只知道他是否是TP53的突变体更了解他的情况。"

在染色体水平上,研究小组发现TP53基因丢失有明显的模式

"在一些癌症基因中,你会看到两个基因的一个拷贝丢失或突变,"Donehower说。"超过91%的癌症都会丢失两个TP53基因,而不仅仅是一个。"

这第二个基因丢失是由于突变、染色体缺失或基因重复而发生的。据Donehower介绍,基因重复的案例发生率远高于之前的想象。

研究还显示,TP53突变与基因组不稳定有很强的相关性,说明正常蛋白在监测染色体完整性方面的作用。在大多数TP53突变的肿瘤中,其他肿瘤抑制基因被删除,而让癌症发生的癌基因则被放大。

研究意义

虽然已经对TP53进行了许多研究,但这是第一次使用五种不同的数据收集方法来研究如此大量的肿瘤和癌症类型。Donehower说,这项研究的规模使他的团队能够注意到在较小样本中可能不明显的模式和相关性。1万名癌症患者的p53突变使人们对该基因的功能有了新的认识。

"大多数关于TP53的研究都集中在一种癌症类型上,"Donehower说。"从32种不同的癌症类型来看,你会看到某些模式成立,无论癌症类型如何。"

研究作者、贝勒医学院Lester和Sue Smith乳腺中心癌症基因组学主任David Wheeler博士说,这项研究的结果可能为治疗受该基因丢失影响的癌症打开了新方法的大门。

"由于TP53是预防癌症的最重要的守门人之一,我们越了解这个基因,就越能了解癌症的基本生物学。这将带来更好的疗法。"人类基因组测序中心和贝勒大学Dan L Duncan综合癌症中心的成员Wheeler说。

引用

Baylor College of Medicine. "p53 mutations in 10,000 cancer patients shed new light on gene's function." ScienceDaily. ScienceDaily, 30 July 2019. www.sciencedaily.com/releases/2019/07/190730141834.htm.

上一篇下一篇