10K基因组计划探索罕见变异对人类疾病,危险因素的贡献

2020-11-26 198罕见病

迄今为止最大的群体基因组测序工作发表在《自然》杂志上。同时在《自然》、《自然遗传学》、《生物信息学》和《自然通讯》上发表了一系列描述数据资源和应用的论文。

10K基因组计划探索罕见变异对人类疾病,危险因素的贡献

罕见的基因变异是指在一个群体中只有相对较少的人携带的DNA变化。UK10K的研究旨在探索这些罕见的基因变异对人类疾病及其危险因素的影响。

威尔康信托桑格研究所的通讯作者尼科尔·索兰佐博士说:“该项目为描述稀有基因变异在各种疾病和人类特征中的作用做出了重要的新贡献。”研究表明,几千个个体的测序对于高度渗透、罕见的疾病具有很高的价值,但是对于复杂性状和疾病,在未来的研究中需要更大的样本量。该项目产生的数据和结果将有助于今后的努力。”

研究内容

该项目研究了近1万名健康和受疾病影响的人。这些疾病包括家族遗传的非常罕见的疾病,以及更常见的疾病,如自闭症、精神分裂症和肥胖。在健康人群中,研究了64种不同的生物医学危险因素,如血压或胆固醇水平。通过描述这些个体的DNA序列,该项目深入了解了稀有变异对多种疾病的影响,并发现了新的遗传变异和基因,以支持疾病风险。

“UK1K项目提高了基因发现的分辨率。桑格研究所的高级UK10K研究员理查德·杜宾解释说:“它使人们能够接触到英国人群基因组中更密集的一组变异,这些变异可以用来完善我们对表型性状遗传效应的理解。”在早期的研究中,要么是非常罕见的变异有很大的影响,要么是常见的变异,通常只有很小的影响,可以分析。现在,我们已经能够探索非常罕见和普通物种之间更多的变异。”

10K基因组计划探索罕见变异对人类疾病,危险因素的贡献。与其他研究人员合作发表在《自然》和《自然遗传学》上的一系列论文证明了这些数据对基因发现的价值。

研究意义

随着对复杂疾病遗传基础特征的不断研究,这项研究的数据和结果有望促成下一波发现。UK10K参考序列,在发表《自然通讯》上的一篇论文中有更详细的描述,它已经被证明可以极大地提高描述全球研究界可用的大样本中稀有变异的能力。这一资源将使研究人员“填补”低分辨率基因型研究中缺失的数据,使他们能够更快、更廉价地探索完整的基因型。

10K基因组计划探索罕见变异对人类疾病,危险因素的贡献。此外,作者还开发了一个基于Dalliance平台的基于web的关联浏览器,这在生物信息学的一篇论文中有描述。这个基因组浏览器允许检索研究中分析的所有疾病风险特征的关联结果。研究这些特定疾病风险因素的科学家将能够直接获得一个人的DNA序列的结果,以了解他们拥有的任何遗传变异有多普遍,以及这些变异与哪些特征有关。

“UK10K项目是一项巨大的事业,为未来的研究奠定了基础,”桑格研究所的主要作者克劳迪娅·沃尔特说例如,新的UK10K单倍型参考小组的好处已经在国际财团的分析以及50万人英国生物银行研究中得到实现。”

引用

Wellcome Trust Sanger Institute. "10K genomes project explores contribution of rare variants to human disease, risk factors: Landmark study confirms complexity, informs the next stages of research." ScienceDaily. ScienceDaily, 14 September 2015. www.sciencedaily.com/releases/2015/09/150914114530.htm.

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