癌症基因组“暗物质”中新的致癌突变

2019-11-26 1087健康相关癌症

癌症基因组“暗物质”中新的致癌突变,一个由安大略省领导的研究小组在人类癌症基因组的大量非编码区域发现了一种新的致癌突变,也被称为人类癌症DNA的“暗物质”。

2019年10月9日发表在《自然》杂志上的两项相关研究描述了这种突变,它代表了一种新的潜在治疗靶点,可以治疗多种类型的癌症,包括脑癌、肝癌和血癌。该靶点可用于开发治疗这些难以治疗疾病的新疗法。

研究背景

“构成基因组98%的非编码DNA是出了名的难研究,而且经常被忽视,因为它不编码蛋白质,”该研究的联合领导、安大略癌症研究所(OICR)适应性肿瘤学负责人Lincoln Stein博士说。“癌症基因组“暗物质”中新的致癌突变。通过仔细分析这些区域,我们发现DNA密码的一个字母发生了变化,可以引发多种癌症。反过来,我们发现了一种新的癌症机制,我们可以针对这种疾病进行治疗。”

癌症基因组“暗物质”中新的致癌突变

研究小组发现,这种被称为U1-snRNA突变的突变可以破坏正常的RNA剪接,从而改变致癌基因的转录。这些分子机制代表了治疗携带突变的癌症的新方法。一种潜在的治疗方法包括对现有药物进行重新利用,绕过早期药物开发阶段,以更快的速度进入临床。

“我们意想不到的发现揭示了一个全新的方式针对这些癌症非常难以治疗,有很高的死亡率,”发育和干细胞生物学高级科学家Michael Taylor博士说。“我们发现,只要DNA编码中出现一个‘错误’,就会产生数百种突变蛋白,我们可以利用现有的免疫疗法来锁定这些突变蛋白。”

在患有某些亚型脑癌的患者肿瘤中发现了U1-snRNA突变,包括几乎所有研究样本来自成年刺猬音髓母细胞瘤患者。慢性淋巴细胞白血病(CLL)是最常见的成人白血病类型,而肝癌是最常见的肝癌类型。

“这一发现是OICR如何与安大略省和世界各地的合作伙伴合作,支持可以用于开发全球癌症患者精确治疗的前沿研究的一个例子,”OICR总裁兼科学主任Laszlo Radvanyi博士说。

项目组织

两个相关的出版物——一个关注脑癌,另一个关注CLL和肝癌——他们都是由安大略省的研究人员领导的,包括多伦多大学外科、实验室医学和病理生物学系的教授Michael Taylor博士和OICR的Lincoln Stein博士。这两项研究都有国际合作者参与,包括奥维耶多大学的Xose Puente博士、生物统计学研究所的Elias Campo博士和巴塞罗那大学等。

这些研究的部分动力来自OICR领导的全基因组泛癌症分析(PCAWG)项目,该项目是迄今为止规模最大的协同癌症研究项目之一,分析了国际癌症基因组联盟(ICGC)的2800多个癌症全基因组。

这项研究部分由OICR通过安大略省政府提供的资金资助的转化研究项目资助。这项工作还得到了加拿大基因组和患病儿童基金会的部分资助。

引用

Ontario Institute for Cancer Research. "New cancer-driving mutation in 'dark matter' of the cancer genome: Change in just one letter of DNA code in a gene conserved through generations of evolution can cause multiple types of cancer." ScienceDaily. ScienceDaily, 9 October 2019.
www.sciencedaily.com/releases/2019/10/191009132328.htm.

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