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赌一包辣条,这个动物园你绝对没来过...

2019-07-31 56其它数据库

作为小动物爱好者的尐尐呅,一直保持着每去一个新地方,都要打卡当地动物园和海洋馆的习惯。

最近尐尐呅在看文献的时候,居然也打卡了一个动物园,这是一个被装进数据库的动物园。

背景小知识

基因是重要的遗传物质,除了我们知道的DNA(脱氧核糖核酸),还有RNA(核糖核酸)。其中小分子非编码RNA(sncRNA),在动物进化上保守的,即这样的小分子在人类中也存在相似的形式和功能,所以利用其它动物的sncRNA信息,可以寻找人类疾病早筛及治疗的新靶标。

ASRA:sncRNA动物园

为了监测小动物的健康情况,动物园会定期采集它们的血样,来自德国萨尔兰大学的生物信息和人类遗传学家发现这些血样中的存在生物标志物(sncRNA)。

2016到2018年间科学家们通过和动物园合作收集并分析了21只动物的血样,包括浣熊、企鹅、亚洲象等。

本次实验研究的是血液中的miRNA,这是核糖核酸特定分子片段,在基因控制中起到重要作用。虽然目前可以利用AI寻找这些片段与疾病的联系。但是AI难以了解哪些生物标志物存在普遍的影响,哪些只是个体上的特殊差异。而这就是动物血样发挥作用的地方。

研究人员将此项研究结果发表在了《Nucleic Acids Research》杂志,此外他们还构建了一个数据库ASRA:https://www.ccb.uni-saarland.de/asra/。到目前为止,科学家已经检测了总共40种动物的血液,其中有蟒蛇、袋鼠等。

如何打卡ASRA?

登录ASRA,首页搜索框输入你需要查询的RNA名称或物种名称即可获取信息,例如搜索大象。

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如果你想知道ASRA里面有哪些物种信息,也可以点击左侧overview,即可获得所有物种及相关序列信息。

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CNGBdb除了有动物园还有植物园

打卡完别人家的动物园,其实CNGBdb上不仅有动物园还有植物园...

打卡指南1:首页---科学数据库,打卡鸟类及鱼类王国

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打卡指南2:首页---数据资源,打卡瑞丽植物园

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参考文献

Fehlmann T, Backes C, Pirritano M, et al. The sncRNA Zoo: a repository for circulating small noncoding RNAs in animals[J]. Nucleic acids research, 2019, 47(9): 4431-4441.

图片来源:ASRA、CNGBdb官网,如有侵权请联系删除。

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