冠军出炉!2022『猛犸杯』国际组学数据创新大赛圆满收官

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2月26日,由中国生物信息学学会(筹)、广东省科技基础条件平台中心指导,深圳国家基因库、鹏城实验室、深圳华大生命科学研究院主办的2022『猛犸杯』国际组学数据创新大赛(2022 MICOS)决赛在广州顺利举办。

经过初赛、复赛的严格评审筛选,13支队伍从400余个参赛团队中脱颖而出进入本次的最后决战。经过激烈角逐决出最终结果:来自清华大学的“广告位招租”团队和来自重庆医科大学附属第二医院的“重医附二院130岁生日快乐”团队分别荣获时空组学细胞数据分析赛道和精准宏基因组丰度计算赛道的一等奖,另外11支来自北京大学、复旦大学、电子科技大学等高校或机构的队伍分别荣获双赛道的二、三等奖和优秀奖。

2022『猛犸杯』国际组学数据创新大赛于去年6月启动,采用时空组和宏基因组双赛道模式,旨在深入聚焦生命科学行业发展的新动态、新趋势、新技术,促进生命科学领域创新发展。2022 MICOS共吸引400余支队伍参与,其中时空组赛道284支队伍,宏基因组赛道161支队伍,覆盖埃默里大学、清华大学、北京大学、复旦大学、上海交通大学、浙江大学、西安交通大学、西北农林科技大学、武汉大学、中山大学、中国科学院上海营养与健康研究所、中国工程物理研究院、中国科学院计算技术研究所、中国科学院数学与系统科学研究院等高校/研究院,以及浪潮、江苏省软件产品检测中心、武汉众邦银行、吉因加等企业。

中国科学院院士杨焕明,广州实验室国家生物信息中心粤港澳大湾区节点主任兼首席科学家李亦学,广东省科技基础条件平台中心主任罗亮,广东省科技基础条件平台中心副研究员赵晓萌,深圳华大生命科学研究院副院长顾颖,鹏城实验室双聘助理研究员、哈工大(深圳)数据安全研究院副院长韩培义,中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员刘永鑫,同济大学生命科学与技术学院研究员王晨飞,香港科技大学数学系副教授杨灿,麻省理工学院博士后研究员邱肖杰,SAGE出版社执行主编楼颖等作为嘉宾/评委以线上和线下的形式参与本次决赛。

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2022 MICOS决赛分为答辩路演和学术沙龙两个环节,让我们一起回顾一下决赛精彩画面!

重磅嘉宾  寄语/致辞

杨焕明院士寄语:“科学需要好奇心和创新力。想成为优秀的科学家要积极地求师交友,关注科学进展,怎么讲其实并不重要,重要的是让我们看到对科学的付出一定会得到应有的收获。”

接下来广东省科技基础条件平台中心罗亮,广州实验室国家生物信息中心粤港澳大湾区节点主任兼首席科学家李亦学,深圳华大生命科学研究院副院长顾颖莅临现场为2022 MICOS致辞。

广东省科技基础条件平台中心主任罗亮致辞:“广东省科技基础条件平台中心一直致力于研究科技资源的优化配置,推动科技资源的开放共享。2022 MICOS的成功举办将推动数据技术进步和产业创新!对进一步提升我省科学数据工作水平具有重要意义。”

广州实验室国家生物信息中心粤港澳大湾区节点主任兼首席科学家李亦学致辞:“今年的全国生物信息学与系统生物学学术大会首次采用“会&赛”结合的形式融入中国生物信息学学会(筹)指导的2022 MICOS,为多领域专业人才提供交流平台,推动计算工具的开发及应用,促进生物信息领域人才体系建设。”

深圳华大生命科学研究院副院长顾颖致辞:“2022 MICOS首次开启双赛道模式优化时空组和宏基因组两个领域的算法。接下来深圳国家基因库和深圳华大生命科学研究院还计划围绕DNA存储技术算法优化等问题发起2023『猛犸杯』大赛,希望大家继续关注『猛犸杯』,期待有越来越多不同学科背景的人才参与进来,共同推进BT与IT多维融合!”

晋级团队  终极PK

2022MICOS决赛答辩环节由中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员刘永鑫,鹏城实验室AI靶场架构师孙慧玲,香港科技大学数学系副教授杨灿,深圳华大生命科学研究院生物智能技术研究所副所长张勇,未知君AI高级总监胡双威坐镇担任时空组、宏基因组赛道评委,进入决赛的13支队伍分别对各自的算法模型展开精彩论述。每支参赛队伍论述结束后,评委专家进行提问,随后从算法模型创新性、架构设计、复杂度以及答辩过程的PPT陈述、逻辑性等方面进行评分。

本次大赛的最终评分由线上得分和答辩得分两部分组成,按二者加权后的最终得分进行排名。经过激烈的角逐,本次大赛的结果正式揭晓:

时空组学细胞数据分析赛道:冠军队伍的算法模型通过共享算子有效节省内存占用,计算速度相较于基线模型提升4~6倍。
精准宏基因组丰度计算赛道:冠军队伍的算法优化索引大小和检索速度(提升10倍)。

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学术大咖  共话BT×IT新进展

2022 MICOS决赛首次融入学术沙龙环节BT、IT领域专家围绕时空组、单细胞、宏基因组、大数据、特刊发表等主题分享前瞻洞见,展示BT×IT多维融合新进展。

鹏城实验室双聘助理研究员、哈工大(深圳)数据安全研究院副院长韩培义作了基于中国算力网的可信数据空间的主题分享;中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员刘永鑫则分享了宏基因组数据分析和科学传播;同济大学生命科学与技术学院研究员王晨飞,香港科技大学数学系副教授杨灿,麻省理工学院博士后研究员邱肖杰,分别介绍了单细胞和时空组领域最新算法工具的开发及应用;最后SAGE出版社执行主编楼颖则针对特刊发表,进行了特刊发表技巧和益处主题分享。

至此2022『猛犸杯』国际组学数据创新大赛圆满收官。参赛选手们纷纷表示这是一次难忘的经历:全力以赴比拼,轻松愉快交流,激发全新灵感。这不仅是一场竞赛,也是一次跨学科的求师交友,让不同学科背景的专业人才在此碰撞出组学数据算法新思路。

未来,国家基因库将围绕生命科学前沿热点,基于国家基因库生命大数据平台的科技资源,以解决行业实际问题/挑战为目标,持续开展『猛犸杯』系列大赛。通过跨领域人才的交流协作,推动更多计算工具的开发、优化及应用,为科学研究及产业发展带来新视角。

赛事组织单位

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