非人灵长类动物(猕猴)全细胞图谱(NHPCA)入选2022年中国医药生物技术十大进展

2023-02-23 797CNGBdb

2月18日,2022年中国医药生物技术十大进展评选结果发布。其中由深圳华大生命科学研究院领衔的多国科研团队发布全球首个非人灵长类动物(猕猴)全身器官细胞图谱(NHPCA)成功入选本次十大进展。

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中国医药生物技术十大进展评选由中国医药生物技术协会指导,《中国医药生物技术》杂志主办。活动分为推荐申报、专家初审、公众投票、院士函审、专家审评和新闻发布6个环节。为体现评选的专业性和权威性,所有候选项目同时提交相关领域的院士进行函审;综合公众投票和院士函审结果,经终审专家会审评,确定了最终的入选项目。

Nature重磅发布全球首个非人灵长类动物全细胞图谱

北京时间2022年4月13日晚,由深圳华大生命科学研究院主导,多国科研团队共同参与的首个非人灵长类动物(猕猴)全身器官细胞图谱 “Cell transcriptomic atlas of the non-human primate Macaca fascicularis” 发表于国际顶级学术期刊《自然》(Nature)。该图谱将为疾病诊疗、靶向药物开发提供支撑,为人类更好地探究生命的进化提供可能。

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深圳华大生命科学研究院联合国家基因库共同搭建的非人灵长类动物百万单细胞交互式资源网站——非人灵长类动物全细胞图谱(NHPCA)数据库于国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)同期上线,旨在为生物医学发展提供一个全面、便捷基于单细胞水平的非人灵长类多组学数据可视化资源库,助力人类疾病研究。

NHPCA非人灵长类多组学数据可视化资源库

NHPCA提供非人灵长类动物各器官所有单细胞类型的转录组及未来不断更新的其他组学数据(例如表观组学等),旨在建立一个完整的非人灵长类单细胞多组学参考图谱,包括正常成年器官单细胞图谱、胚胎发育单细胞图谱以及疾病模型单细胞图谱,为深入理解与人类相关的生理功能和疾病诊断,预测和治疗提供数据支撑。可应用于器官损伤修复、病毒性传染病及遗传疾病的预防和诊疗、药物研发等领域的研究。

目前版本的NHPCA包括成年猕猴45个器官的约114万个细胞的单细胞可视化分析结果,用户可以通过数据库导航栏项目直接获取不同组织中的细胞聚类信息(Clustering)、基因表达/共表达情况(Gene expression)、跨物种比较信息(Cross-species)和细胞间配体受体相互作用(Cell-cell)。

用户使用Analysis功能还可以上传用户单细胞数据及同源基因列表进行细胞类型预测分析。

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NHPCA中的原始数据(数据编号:CNP0001469)及分析过程文件数据均可通过Download功能下载。

此外,NHPCA数据集已在国家基因库生命大数据可信计算平台CODEPLOT上线,用户可使用CODEPLOT平台已部署的分析工具对NHPCA数据集(可加入用户数据)进行在线分析。

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NHPCA由CNGBdb团队开发及维护,使用过程中遇到任何问题或有意见建议均可通过以下方式反馈给我们:

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