2022-11-02 864CNGBdb
10月28日~30日,由广西大学主办的第十一届生物信息与生物医学国际会议(ICBBS 2022)顺利举行。深圳国家基因库(以下简称“国家基因库”)受邀作为协办单位参与本次大会,国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)亮相ICBBS 2022主会场主题演讲,获得国内外生物信息与医学领域研究人员的广泛关注。
ICBBS会议系列一年一届,旨在为世界各地的研究学者 、工程师和科学家提供一个生物信息与生物医学等相关领域的技术进步展示和研究成果发布交流的国际会议平台。
10月29日,在ICBBS 2022主会场主题演讲环节,国家基因库生命大数据平台生物信息助理研究员李小强作为特邀嘉宾,以《CNGBdb:一个用于生命科学多组学数据共享和分析的综合数据平台》为题,介绍了国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)的主要功能、数据资源及其应用。针对生命科学大数据在存储、分析、共享方向面临的挑战,李小强老师还重点展示了CNGBdb在数据存储、可信计算、时空组数据共享应用方面的功能及其相关成果。CNGBdb的亮相获得现场及线上专家的广泛认可及关注,成为主会场主题演讲环节的一大亮点。
国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)为全球科研工作者提供生物大数据智能搜索、汇交管理、可信计算和科学应用等服务,建立大数据搜、存、算、用为一体的闭环,助力科研合作、成果发表,促进生物、医学、农业等产业发展。
本次会议CNGBdb重点展示了三大重要功能:存-数据管理和文章发表助手——国家基因库序列归档系统(CNSA);算-"0"基础数据在线分析平台——生命大数据可信计算平台CODEPLOT;用-时空组学数据库V1.0版(STOmicsDB)。
国家基因库序列归档系统(CNSA)是一个方便快捷的生命科学数据归档系统,提供测序数据及分析结果数据归档服务。CNSA遵循国际通用的组学数据标准,支持项目、样本、实验/ 测序、组装、变异、代谢、单细胞、序列等多种数据类型在线、批量递交。其数据递交服务可作为文献出版流程的补充,支持早期数据的共享。截至2022年10月10日,CNSA已支持论文发表507篇,发表期刊237种,包括TheLancet、Science、Cell等。
CODEPLOT是一个集可信计算环境和多元化在线分析工具于一体的生命大数据分析平台,也是国内率先将数据加密、区块链、安全多方计算、基因安全容器虚拟化等最新安全策略应用于生命大数据分析利用和合作共享的平台。用户无需任何编程背景,就可使用该平台的计算工具进行自动化的生物信息学分析。CODEPLOT为生命科学领域的研究和行业提供了数据共享、工作流管理、弹性云计算资源和安全可信协作环境的全面解决方案。
空间转录组学是一个迅速发展的领域,有望以单细胞或亚细胞分辨率全面表征组织结构。近日,CNGBdb重磅上线的时空组学数据库V1.0版(STOmicsDB)率先建立时空组数据归档标准,实现时空组学不同层次数据的整合,并形成时空组学数据生态圈,是国际领先的时空组学综合平台,致力于促进时空组学的数据探索和学术研究。
截至目前,STOmicsDB V1.0已支撑Nature、Science、Cell在内的11篇文章发表,包括【时空组学联盟第一批生命发育时空图谱】覆盖小鼠、斑马鱼、果蝇、拟南芥四种模式生物胚胎或器官发育,【蝾螈脑再生时空图谱】等。
未来,国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)将继续秉承“安全、开放、共享”的原则,与各领域科研机构、产业单位通力合作,继续发挥大数据技术优势,最大化释放生命大数据应用/转化价值,助力生命科学、医学、农业等领域创新发展。