国家基因库序列归档系统被F1000Research推荐为数据存储库

2022-07-13 279CNGBdb

近日,国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)的存储功能板块:国家基因库序列归档系统(CNSA)被全球首个以开放研究模式发表论文的平台F1000Research推荐为数据存储库。

F1000Research-1.png

CNSA被F1000Research推荐为测序&组学数据存储库

F1000是一种快速出版、开放、为发表提供更多便利的出版模式,旨在让更多学者的研究被看到、知识被分享。其是全球首个以开放研究模式发表论文的平台,具有快速出版能力的同时,可确保论文的质量、再现性和同行评议的透明性。

此次CNSA被F1000Research推荐为数据存储库将进一步提升CNGBdb的国际认可度,推进CNGBdb在数据出版与安全共享方面的持续发展。

CNGBdb是一个为全球科研工作者提供生物大数据汇交管理和共享使用等服务的平台。截至目前,已归档4257个研究项目,多组学数据量达7.5PB,支撑全球300余个科研单位的科研数据汇交和共享。

CNGBdb的存储功能由国家基因库序列归档系统(CNSA)负责。CNSA是一个归档全球组学数据的系统,致力于多组学数据(基因组、转录组、代谢组、单细胞和空间转录组等)的存储、管理和共享,促进组学数据的再利用,推动生命科学的发展,为国内科研人员提供更加安全、规范、可靠、便捷、开放的数据归档系统。

CNGBdb已获得国际主流出版机构/期刊、重大国际合作项目的认可:已通过FAIRsharing认证,被国际科研数据仓储目录re3data和开放存取知识库目录OpenDOAR收录,被国际著名出版商Elsevier收录为指定归档库;获得Wiley、Oxford出版集团、Cellpress、ACS、Cambridge、Microbiology society、Hindawi出版社和Science 、PLOS、PeerJ系列期刊认可,符合SAGE期刊投稿需求;被全球性项目——地球生物基因组计划(Earth BioGenome Project,EBP)指定为数据存储库。此外,递交到CNGBdb的数据统一进行DOI(数字对象标识符)标识,促进共享和利用。

截至2022年6月15日,CNSA已支持论文发表432篇,发表期刊211种,包括The Lancet、Science、Cell等。

F1000Research-2.png

CNGBdb支撑成果发表实例

2021年中山大学公共卫生学院的舒跃龙团队在Science期刊发表重大突破:首次发现人MX1基因稀有变异可能增加人感染H7N9禽流感病毒风险。此项研究中全基因组测序数据及其关联分析的等位基因频率和汇总统计数据已存储于国家基因库生命大数据平台(CNGBdb),项目编号分别为:CNP0001997CNP0001481

未来,CNGBdb将继续在严格保障数据安全的前提下,以切实服务用户需求为驱动,与全球期刊展开深入合作,为全球科研工作者提供更加便捷高效的服务。

上一篇下一篇

相关专题