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【传承创新】万种药用植物数据库:跨组学+大数据,促进“一带一路”药用资源深度开发

2019-12-18 122CNGBdb

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广西药用植物园作为世界最大的药用植物园,依托自身丰富药用植物资源的优势,基于“药用植物4.0计划”项目关键任务“药用植物大数据中心建设”,率先构建万种药用植物数据库(10KMP)。

战略保障:药用植物4.0计划

药用植物资源是国家重要的战略资源。我国具有药用植物资源最为丰富、理论体系最为完整的传统药物优势,是现代创新药物研发与应用的重要物质基础保障和理论体系支撑。

药用植物4.0计划是一个基于药效高通量筛选及药用植物生物大数据,通过药用植物数据的跨组学研究,解读药用植物形态、生态、组学与药效,以及药效与疾病间的关系,实现药用植物资源与新药的智慧创制的系统研究工程,是信息技术、生物技术与药用植物高度融合的技术创新体系。

传承创新:构建10KMP

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广西药用植物园基于“药用植物4.0计划”项目“药用植物大数据中心建设”构建的万种药用植物数据库(10KMP)将跨学科数据信息有机地结合起来,不仅将有助于“药物发现”,辅助药企决策,助力新药设计,提高药物大规模筛选效率;而且也将助推药用植物从传统中药、民间草药向有效成分明确、疗效可靠、质量稳定的中药新药方向转变。

CNGBdb已上线:10KMP(一期)

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目前,万种药用植物数据库(10KMP)一期项目及数据已在国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)上线,包含近1000种药用植物的元信息及转录组测序数据(目前数据文件为受控数据,需要申请授权)。

如何使用

  1. 访问10KMP路径提示:CNGBdb官网—数据资源—The 10000 Medicinal Plants project of GuangXi

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  1. 首页搜索框:快速获取药用植物信息
    操作提示:10KMP首页搜索框—输入物种名称(例如鱼腥草,输入Houttuynia cordata即可)—点击搜索

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  1. Tree view:可视化药用植物物种结构、获取药用植物详细信息
    操作提示:根据药用植物的目科属种信息,获取药用植物详细信息,如获取鱼腥草详细信息,可在Tree view板块,按照如下物种结构逐层展开即可:Piperales—Saururaceae—Houttuynia—Houttuynia cordata

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  1. Project:获取项目详情

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未来两年,广西药用植物园将逐步完成超过10000种药用植物的多组学数据收集、分析以及整合,将药用植物基本信息、组学数据信息、有效成分信息、药物信息、疾病信息及药效评价信息这6大类信息彼此联动,初步构建能够支撑我国中药产业发展的知识服务平台,推动中药现代化技术的发展,为中医药的“一带一路”提供有效的数据和知识支持,为中医药的国际化提供数据服务平台。

今天10KMP作为特殊礼物,献礼广西药用植物园60周年庆

访问:10KMP

图片来源:广西药用植物园官网,万种药用植物数据库(10KMP)
温馨提示:药用植物信息为重要的国家战略资源,10KMP中所有药用植物元信息为公开状态,可直接搜索获取相关信息;数据信息为受控状态,需先申请,获得授权后即可查看和下载,申请流程详见:https://db.cngb.org/data_access/。

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