数据存在CNGBdb,可以发这些杂志:The Lancet、Nature、Science、Cell…

2021-06-03 528CNGBdb

作为国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)“存”功能板块,国家基因库序列归档系统(CNSA)不仅是数据管理助手,还是文章发表助手,截至2021年5月8日,CNSA已支持论文发表254篇,发表期刊138种,包括The Lancet、CNS(Nature、Science、Cell)及其子刊等。

CNSA支持发表杂志列表

不止是数据存储,CNSA还能实现

数据存储→分析→文章发表全流程的线上运行及管理

CNSA遵循国际通用的组学数据标准,支持项目、样本、实验/ 测序、组装、变异、代谢、单细胞、序列等多种数据类型在线、批量递交。其数据递交服务可作为文献出版流程的补充,支持早期数据的共享。

截至目前,CNSA已归档2966个研究项目,多组学数据量达4585TB,支撑全球200余个科研单位的科研数据归档和共享。后续,CNSA将根据科研技术的迭代持续更新数据归档类型,完善数据归档标准,同时还将与国家基因库生命大数据可信计算平台CODEPLOT完全“打通”,实现数据存储→分析全流程的线上运行及管理,全面提升科研数据利用及转化效率。

CNSA已支撑多个国际/国内合作项目、重大科研成果的数据管理及共享发布

CNSA已支撑多个国际/国内多项大型合作项目的数据管理及共享发布,包括ICGC-ARGO项目、地球生物基因组计划(EBP)、万种鱼基因组项目、万种植物基因组项目、万种药用植物项目、百万微生态项目、生菜群体测序研究项目等,基于上述科研项目数据资源,CNGBdb还构建了动植物多样性、微生物、健康与疾病等不同方向的科学数据库,以优质的数据和专业的分析工具,帮助研究人员挖掘数据资源、推动科学发现。

CNGBdb支撑杂志系列-1.png

截至2021年5月8日,CNSA已支撑254篇科研成果的发表及其数据的共享发布,其中包括新冠病毒基因组特征和流行病学研究、哺乳动物演化分析、脊椎动物从水生到陆生演化分析、哺乳动物大脑的基因图谱等重大科研成果。

新冠病毒基因组特征和流行病学研究

CNGBdb支撑杂志系列-2.png

发表日期:2020年1月30日
项目概要:由中国科学院微生物研究所、山东第一医科大学等多家研究机构的研究团队在《柳叶刀》发表2019新型冠状病毒的基因组特征和流行病学研究。
项目数据:CNP0000881

跨越1.8亿年,解密哺乳动物祖先染色体

CNGBdb支撑杂志系列-3.png

发表日期:2021年1月6日
项目概要:该研究发表了鸭嘴兽和短鼻针鼹的基因组,并进而对哺乳动物的演化以及单孔目性染色体演化进行了分析,为深入了解哺乳动物的重要演化历程提供了新的结果。
项目数据:CNP0000130CNP0000697, CNP0000779

人类、猪、小鼠大脑中的蛋白编码基因图谱

CNGBdb支撑杂志系列-4.png

发表日期:2020年3月6日
项目概要:该研究基于多种转录组学方法和抗体图谱技术,对大脑不同区域进行了全面、深入的分子解析,并且提供了高质量的蛋白编码基因的分子图谱,为进一步研究提供了有力的武器。该研究成功地构建了哺乳动物大脑的基因图谱,是对现有的若干个大脑图谱项目的重要补充。
项目数据:CNP0000483

揭示脊椎动物从水生到陆生的演化之谜

CNGBdb支撑杂志系列-5.png

发表日期:2021年2月4日
项目概要:两项研究分别解析了原始辐鳍鱼类塞内加尔多鳍鱼、匙吻鲟、弓鳍鱼和鳄雀鳝,以及现生肉鳍鱼类中与四足动物亲缘关系最近的非洲肺鱼共五个物种的基因组。交叉整合了基因组学、进化生物学、鱼类学、古生物学、计算生物学和实验生物学等学科,从不同角度和不同演化节点揭示了脊椎动物水生到陆生转变的遗传基础之谜。
项目数据:CNP0000841

未来,CNSA将继续在严格保障数据安全的前提下,以切实服务用户需求为驱动,不断完善平台功能,与全球期刊展开深入合作,为全球科研工作者提供更加便捷高效的服务。

参考文献:
[1] Lu R, Zhao X, Li J,et al. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. Lancet. 2020 Feb 22;395(10224):565-574. doi: 10.1016/S0140-6736(20)30251-8. Epub 2020 Jan 30.
[2] Zhou, Y., Shearwin-Whyatt, L., Li, J. et al. Platypus and echidna genomes reveal mammalian biology and evolution. Nature 592, 756–762 (2021).
[3] An atlas of the protein-coding genes in the human, pig, and mouse brain, Science  06 Mar 2020, DOI: 10.1126/science.aay5947.
[4] Bi X, Wang K, Yang L, et al. Tracing the genetic footprints of vertebrate landing in non-teleost ray-finned fishes. Cell. 2021 Mar 4;184(5):1377-1391.e14.图片来源:Lancet、Nature、Cell、Science官网,如有侵权请联系删除

上一篇下一篇

相关专题