2021-CNGBdb高校行 | 西北6校巡讲活动圆满落幕√

2021-05-31 503CNGBdb

为了让更多一线科研工作者了解CNGBdb,同时让CNGBdb团队深入了解生命科学领域大数据方向的实际科研需求,助力科研成果转化、创新及产业发展,“2021-CNGBdb高校行”于本月正式启动。

5月24日~28日,CNGBdb来到本次高校行的第一站:大西北,我们走访了西安和西宁的六所高校/研究所:西北农林科技大学、西北工业大学、西安交通大学、中科院西北高原生物研究所、青海大学、青海民族大学,收获了师生们的广泛认可,同时还与多位专家教授探讨生命科学研究与大数据技术融合的合作新模式,共同推进农业、生命科学、医学等领域科研成果转化及创新发展。

在本次高校行活动中,国家基因库大数据应用负责人陈凤珍,国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)数据审编负责人张磊、平台运营负责人华聪分别在6所高校/研究所做主题报告,介绍了国家基因库三库两平台(生物样本资源库、生物信息数据库、动植物资源活体库、数字化平台、合成与编辑平台)的业务架构,以及以此为基础推出的生命大数据平台(CNGBdb)的主要功能(搜、存、算、用)及应用。

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主题报告结束后,CNGBdb工作人员与现场师生进行了交流座谈,其中CNGBdb“搜”、“存”、“算”、“用”四大功能获得现场老师和同学们的广泛关注和认可,他们表示CNGBdb的四大功能可以支撑科研选题→数据管理/分析→成果发表的全科研流程,在今后的日常科研中将会给他们的工作和学习带来极大便利。

同时,CNGBdb的工作人员还与多位专家教授在数据管理、数据挖掘和数据应用等方面进行了深入探讨,并初步达成在生命科学研究与大数据技术融合的新模式下开展合作的意向。

国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)为全球科研工作者提供生物大数据智能搜索、汇交管理、可信计算和科学应用等服务,建立大数据搜、存、算、用为一体的闭环,助力科研合作、成果发表,促进生物、医学、农业等产业发展。

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本次高校行CNGBdb重点展示其主要功能(搜、存、算、用)及应用:搜-新且全的文献/数据搜索功能;存-数据管理和文章发表助手——国家基因库序列归档系统(CNSA);算-"0"基础数据在线分析平台——生命大数据可信计算平台CODEPLOT;用-多领域20+专有科学数据库;应用-重大项目支撑。

搜-CNGBdb-搜数据/文献

CNGBdb除了国家基因库自身的数字化资源储量,还整合了来自NCBI(美国国立生物技术信息中心)、EMBL-EBI(欧洲生物信息研究所)、DDBJ(日本DNA数据库)等几大国际平台的公开数据,覆盖十几个研究领域,形成一个科研数据系统。同时,CNGBdb的文献库收集了3100多万篇文献资源,每日更新文献资源库,为研究人员提供全而新的文献资源检索服务。

存-CNGBdb-存数据/发文章

国家基因库序列归档系统(CNSA)是一个方便快捷的生命科学数据归档系统,提供测序数据及分析结果数据归档服务。CNSA遵循国际通用的组学数据标准,支持项目、样本、实验/ 测序、组装、变异、代谢、单细胞、序列等多种数据类型在线、批量递交。其数据递交服务可作为文献出版流程的补充,支持早期数据的共享。截至2021年5月8日,CNSA已支持论文发表250余篇,发表期刊138种,包括The Lancet、Nature、Science、Cell等。

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算-CNGBdb-可信计算平台

CODEPLOT是一个集可信计算环境和多元化在线分析工具于一体的生命大数据分析平台,也是国内率先将数据加密、区块链、安全多方计算、基因安全容器虚拟化等最新安全策略应用于生命大数据分析利用和合作共享的平台。用户无需任何编程背景,就可使用该平台的计算工具进行自动化的生物信息学分析。CODEPLOT为生命科学领域的研究和行业提供了数据共享、工作流管理、弹性云计算资源和安全可信协作环境的全面解决方案。

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用-CNGBdb-科学数据库

CNGBdb作为国内最大的生物大数据中心之一,收录和整合了国家基因库及全球其他重要数据源的多领域数据资源,构建动植物多样性、微生物、健康与疾病等不同方向的科学数据库,以优质的数据和专业的分析工具,帮助研究人员挖掘数据资源、推动科学发现。

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应用-CNGBdb-重大项目支撑案例

目前,CNGBdb已支撑国际/国内多项大型合作项目,包括ICGC-ARGO项目、地球生物基因组计划(EBP)、万种鱼基因组项目、万种植物基因组项目、万种药用植物项目、百万微生态项目、生菜群体测序研究项目等。

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2021-CNGBdb高校行活动正在进行中,如果您希望我们来到您的身边,可以关注『国家基因库大数据平台』微信公众号,后台直接给我们留言!

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