数据存在CNGBdb,可以发哪些杂志?【Nature Genetics】 | CNGBdb-Question Time

2021-04-01 71CNGBdb

数据存在CNGBdb,可以发哪些杂志?

Nature Genetics

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2019年3月,由浙江大学主导的海岛棉和陆地棉基因组研究论文发表在国际权威学术期刊《自然-遗传学(Nature Genetics)》,标志着我国四倍体棉花基因组学研究取得了国际领先的地位。研究团队通过整合Illumina PCR-free short-read测序、10x Genomics测序、Hi-C以及光学和超密集遗传图谱的数据,对两种栽培的异源四倍体物种的基因组进行从头组装,在组装的连续性和准确性上获得实质性的改进,尤其突出的是着丝粒的组装。此项研究产生的测序数据已保存在CNGBdb,项目编号:CNP0000046

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2019年4月29日,由国际半干旱地区热带作物研究所和华大基因等单位合作完成的迄今最大规模鹰嘴豆群体重测序研究成果发表于《Nature Genetics 》。该项目在鹰嘴豆群体重测序研究当中是迄今为止规模最大的,通过对大量样本测序数据进行分析和挖掘,研究团队清晰描绘了鹰嘴豆的起源与演化路径,鉴定了与鹰嘴豆耐旱、耐热、抗病等功能相关的基因,为培育高产、抗逆鹰嘴豆品种提供了充分的理论依据和宝贵的遗传资源。此项研究产生的测序数据已保存在CNGBdb,项目编号:CNP0000370

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2019年5月31日,《Nature Genetics 》在线发表了由华中农业大学严建兵团队主导,华大基因等单位参与的玉米基因组研究成果:“Genome assembly of a tropical maize inbred line provides insights into structural variation and crop improvement”。该研究公布了迄今为止质量最高的热带玉米参考基因组,并公布了首份玉米结构变异图谱,结合这些信息首次从自然变异中定位到影响玉米粒重的关键基因。此项研究的数据已保存在CNGBdb,项目编号:CNP0000417CNP0000418CNP0000419CNP0000420

《Nature Genetics》发表有关遗传学的最高质量的研究, 包括人类和植物性状以及其他模式生物的遗传和功能基因组研究。目前的重点是通过实验性干扰研究常见和复杂疾病的遗传基础,以及基因网络的功能机制、结构和进化。

收稿范围

包括但不限于:人类疾病病理学中的基因、简单和复杂遗传性状的分子分析、癌症遗传学、农业基因组学、发育遗传学、基因表达的调控变异、从基因组数据中提取功能的策略和技术、药理学基因组学、基因组进化

稿件类别

Nature Genetics的稿件类型有:Article | Letter | Technical Report | Brief Communication | Analysis | Correspondence | Matters Arising | News and Views | Book Review | Review | Commentary | Perspective

Article:一项实质性的新颖研究,往往涉及多项技术或方法。正文(不包括摘要、在线方法、参考文献和图例)为2000~4000字。摘要一般为100字,文章最多有8个显示项(图和/或表)。

Letter:一项重要的新研究成果。这种格式以150字左右的引言段(不是摘要)开始,概述背景、原理、主要结果和意义。正文字数控制在1500字以内(不包括引言段、在线方法、参考文献和图例)。Letters的展示项目(图和/或表)不超过6个。

Technical Report:介绍可能具有影响力的新技术的主要研究数据,其不是对技术的评论,而是文献中的主要报告。它可能涉及新的生物学发现,以证明该技术的实用性,但这不是必需的。尽管许多Technical Report都比典型的Article短,但Technical Report的格式与Article的格式大致相似。它们以未引用的摘要(通常为150个单词)开头,其后分别是介绍、结果、讨论(带有可选副标题)和在线方法的各个部分。展示项目(图和/或表)的数量没有严格限制。作为指导方针,技术报告最多可提供30篇参考文献。

Brief Communication:报告了一个高质量和广泛的兴趣简明的研究。不得超过3个印刷页。简要通讯以简短的无参考文献的摘要开始(3句话,不超过70个字),摘要将出现在Medline上。正文一般为1000~1500字,包括摘要、参考文献和图例,不含标题。简要通讯一般不超过2个显示项目,作为指导原则,简讯最多允许有 20 条参考文献。

Analysis:Analysis是对现有数据(通常是来自芯片或其他高通量平台的大型基因组、转录组或蛋白质组数据集)或技术比对中获得新数据进行新的分析,从而得出对广大读者具有重要意义的新颖的结论。正文(不包括摘要、在线方法、参考文献和图例)约3000字。摘要一般为100~150字,无参考文献。分析的展示项目(图和/或表)不超过6个。作为指导原则,Analysis最多允许有50个参考文献。

Review:综述是对某一研究领域的最新发展进行的权威性、平衡性和学术性的调查。对平衡的要求并不会阻止作者提出一个特定的观点,但如果在这个领域存在争议,作者必须以公平的方式对待它们。综述通常在3000~4000字,也鼓励插图。作为一个指导方针,允许最多100个参考,在特殊情况下可能有例外。综述的范围应该足够广泛,不应被单个实验室的工作所主导,特别是不应被作者自己的工作所主导。

*由于篇幅有限,其他稿件类型的具体要求可参见:https://www.nature.com/ng/about/content

编辑流程/周期

Nature Genetics的编辑流程,可以概括为以下几个步骤:

  1. 作者提交稿件后,会收到一个跟踪号。
  2. 稿件会指派给编辑。
  3. 编辑组决定是否把手稿送审。如果决定不将稿件送审稿,编辑将与作者联系。
  4. 编辑指派可能的审稿人审稿,并通知作者。
  5. 审稿人同意审稿。
  6. 审稿人把审核报告提交给编辑。
  7. 编辑小组讨论报告,编辑作出最后决定。这一过程可能涉及到与审稿人的进一步协商以及审稿人之间由编辑调解的沟通。
  8. 编辑就上述决定与作者联系。
  9. 如果决定是否定的,作者可以选择把他们的稿件转到另一个期刊。如果手稿被同行评审,审稿意见也会被转移。

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《Nature Genetics》提供研究文章的提前在线出版(AOP)。在同行评审之前或之后拒稿的稿件,作者可以按照编辑决定邮件中提供的链接,轻松地将稿件重新投稿到《Nature》系列中的其他期刊,在大多数情况下,无需重新格式化或上传文件。

图片来源于Nature Genetics官网

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