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走进国家基因库生命大数据平台 | 直播回顾

2019-09-20 44CNGBdb

2019/9/19直播活动顺利上线,这是一个1700+观看人次、1000+赞的直播现场

直播回放https://vzan.com/live/LiveIntroduce-1391481035?v=0.6453037939770288

开场小测试:你了解国家基因库吗?

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Q:上述关于国家基因库的描述哪些是错误的?
A:5和7是错误的。国家基因库坐落于深圳大鹏新区,具有三库两平台的架构。

科研流程下CNGBdb的正确打开方式

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确定研究方向:搜

文献库:包含影响因子、引用量、endnote等信息方便文献筛选,同时在文献中关联蛋白、序列、基因信息,实现文献与数据的无缝对接。
知识图谱:将相关科研领域内文献、作者、科研关键词间的网络关系可视化,让研究热点、学术大牛、优质论文、文献引证关系等一览无余,将极大地方便相关知识的获取、整理和使用。

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寻找资源:样本信息共享平台(EBB)

整合国内外生物样本信息和样本库信息,可直接通过此平台进行样本申请,申请通过样本可寄送至申请人处。
EBB已支撑了多个项目的文章发表与资源共享:
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分析:算

BLAST:动植物和微生物数据分析一般都会用到的blast计算工具,我们整合了外部(NCBI)和CNGBdb特有的数据资源。
可信计算(即将上线):在可信环境下的0成本、0门槛、个性化的分析平台。

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文章发表:CNSA

CNSA是一个方便快捷的在线提交生物研究项目、样本、实验、测序、变异等信息数据的系统,目前已经支撑发表90+的文章(含预印)。

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温馨提示:CNSA文章列表每月更新,查看方式:微信公众号菜单栏---课程干货---CNSA科研支撑成果。

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样本数据二次利用:样本信息可提交至EBB,数据可归档至CNSA。
科学数据库:基于CNGBdb的底层数据结构和数据,构建不同领域方向的数据应用,旨在针对不同的研究领域提供科学数据服务。

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答疑解惑

  1. 数据存储在CNSA,储存空间大小有限制吗?
    目前是免费、无上限的数据存储,我们希望您提交的数据是科研相关数据,并且在后续是可开放共享的。

  2. 请问如果是测序数据上传的话,是否可以database直接文章发表引用(data availability)?
    是的。目前已经有40+的杂志可直接引用CNGBdb的数据。

  3. 一些案例的比较,查什么方向的数据我们这里查会比NCBI更好?
    相比NCBI,有一些动植物及微生物资源是我们这边特有的,比如千种植物、免疫数据库等,还有一些中国人群特有的数据。

  4. 数据安全怎么做的?是否有权限?分级管理?
    目前的数据有公开、受控和私有的权限分级,其中受控的数据可申请使用,可共享的受控数据可通过查找元信息,提交申请,申请通过即可获得数据下载权限。

  5. 文献高级检索,不能作者、单位检索么?
    可以对作者和期刊进行高级检索,而且用户可在搜索框直接输入作者、期刊进行检索。CNGBdb采用了人工智能语义识别技术,对作者和期刊智能识别后进行检索,提升文献检索准确度。

小编碎碎念

  1. 直播期间抽到优惠券及折扣券的朋友可联系听课君领取。
  2. 关于CNGBdb的任何疑问和建议可通过以下方式反馈给我们。

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