CNGBdb科学数据库,你用过几个?【疾病篇】 | CNGBdb-Question Time

2021-01-06 129CNGBdb

CNGBdb的科学数据库是基于CNGBdb平台数据,整合其他数据源构建的多组学应用数据库,覆盖动物、植物、微生物、病原、疾病与健康等研究领域。

疾病篇

癌症数据集成与分析平台

DISSECT包含ICGC、TCGA等多个数据库的大量癌症基因组和临床数据,当前已覆盖37个癌种(包括亚型),并将持续更新。除提供数据查询服务之外,DISSECT具备多种在线分析工具以及图表可视化展示功能,从单群体、单数据类型到跨群体、多数据类型,都可以方便地进行个性化的分析研究。此外,还开发了ACMG动态解读功能模块,可根据ACMG(美国医学遗传学与基因组学学会)遗传变异分类标准与指南,对癌症相关的基因种系变异进行临床解读。

DISSECT使用指南?

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CDCP:单细胞数据库

CDCP集成了CNGBdb平台的单细胞数据资源(截至2021年1月5日包括7165个样本和338280个细胞),为用户提供单细胞数据分析、可视化、下载和递交功能。此外,CDCP还提供了其他单细胞数据库的入口方便用户使用,例如HCL(人类细胞图谱)、NHPCA(非人灵长类单细胞图谱数据库)等。

CDCP使用指南?

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PIRD:免疫数据库

PIRD收集了人类和其他脊椎动物不同表型的原始和加工的免疫球蛋白(IGs)和T细胞受体(TCR)序列,为疾病健康领域研究者和临床医生等用户提供数据查询、比对和可视化分析功能。

科学数据库-3.png

GDRD:罕见病数据库

罕见病数据库(GDRD)是一个综合的遗传病和罕见病研究与应用平台,关注人类遗传变异和表型信息的收集、存储、分析、挖掘。当前版本整理了约7000余篇文献,1万多个致病变异,近300个遗传病家系的信息。用户可通过变异、基因、疾病、表型关键词进行搜索。

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此外,研究感染疾病的专家/学者还可以使用VirusDIP:病毒数据平台和PVD:病原数据库进行相关研究。

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Dr.羊&听课君图片原创:CNGBdb 魏晓锋
编辑:尐尐呅

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