“大数据+”助推生命科学、医学、农业创新发展!ICG-15国家基因库分论坛精彩回顾

2020-10-28 72CNGBdb

10月25日至31日,第十五届国际基因组学大会(ICG-15)在中国武汉隆重召开。作为组学领域最有影响力的年度会议之一,ICG-15共设22个分论坛,来自21个国家的160多位科学家(包括13位中国科学院或工程院院士)通过线上、线下两大渠道,带来一场顶级学术盛宴。

10月27日,由深圳国家基因库承办的“大数据分析与生物样本库”(Ⅲ-1)和“未来农业、未来食品与全球发展”(Ⅲ-5 )两场分论坛举行,13位国内外知名资深专家受邀出席,以专题报告分享最新科研成果、权威应用经验及独到的行业洞见,串联基因组技术、大数据技术和未来农业,发掘生命科学、临床医学、未来农业研究的创新机遇。

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在此期间,国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)重磅发布生命大数据可信计算平台CODEPLOT,将生命大数据的安全共享和利用转化带上了一个新台阶。

“大数据分析与生物样本库”论坛

“大数据分析与生物样本库”(Ⅲ-1)于上午8:35正式开始。首先,分论坛联合主席、中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心主任马俊才进行了开场致辞,他对与会嘉宾的到来表示热烈欢迎,指出大样本、大数据背景下的科学研究正面临新挑战,希望通过本次分论坛的跨领域交流,和与会专家们共同发掘生物样本库、大数据分析技术等方面的融合创新方向。

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中国科学院计算机网络信息中心科学数据中心主任黎建辉教授以《开放共享的数据规则、政策和实践》为题,介绍了全球开放数据政策和FAIR数据原则,并分享了一些值得借鉴的实践经验。

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日本国家遗传学研究所DDBJ中心数据库部负责人Yasukazu Nakamura教授作以《DDBJ和INSDC》为题,介绍了目前DDBJ以及INSDC的核苷酸序列产出、互通和数据库建设情况。

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生物芯片上海国家工程研究中心主任郜恒骏教授在《以样本为基石的新型临床转化医学CBDTM模式:19年探索》报告中,分享了生物芯片上海国家工程研究中心创立19年来所践行的的CBDTM发展宗旨与模式,指出该模型与临床转化医学的整合极大地推动了新型临床医学的学科建设和个性化精准医疗的发展。

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默多克大学高级讲师王鹏浩博士以《基因型与环境数据相结合精确预测大麦表型》为题,介绍了其团队利用小麦基因型和环境多因素建立的GxE模型,指出从原理上讲,该模型有助于培育高产量的作物品种,并对作物的关键表型发育情况进行准确预测。

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英特尔公司首席工程师兼解决方案架构师Michael J. McManus博士以《基因组学将改变健康的3种方式》为题,介绍了新生抗原在癌症治疗中的应用、组织基因组学及其在精准医疗中的创新实践、基因组技术在对抗COVID-19大流行中的作用。

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GigaScience、GigaByte杂志主编Scott Edmunds博士以《GigaByte:发布大规模基因组的新平台》为题,从数据出版的视角介绍了GigaByte如何帮助科研人员快速简便地分享研究成果,高效展现大数据研究的持续进展,促进数据、软件、计算工作流等的再利用。

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CNGBdb重磅发布生命大数据可信计算平台CODEPLOT

“大数据分析与生物样本库”论坛上,国家基因库生命大数据平台(CNGBdb)重磅发布生命大数据可信计算平台CODEPLOT(https://db.cngb.org/codeplot/)。国家基因库副研究员丁远彤博士以《可信环境下的计算平台》为题,详细介绍了CODEPLOT的具体功能及使用场景。

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CODEPLOT是一个集可信计算环境和多元化在线分析工具于一体的生命大数据分析平台,也是国内首个将数据加密、区块链、安全多方计算、基因安全容器虚拟化等最新安全策略应用于生命大数据分析利用和合作共享的平台。该平台以数据汇交模块存储的海量数据为支撑,以灵活工作空间管理模式为核心,同时提供多元化分析工具,全面打通各科研机构之间的数据孤岛,突破数据分析门槛,提升数据利用率,促进重大科研项目合作共享及成果转化。

CODEPLOT由CNGBdb团队设计开发,由华大磐石提供安全相关的技术支持。CODEPLOT的正式发布获得现场及线上专家的广泛认可及关注,其正式上线意味着生命大数据的安全共享和利用转化上了一个新台阶。

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“未来农业、未来食品与全球发展”论坛

晚上19:00,“未来农业、未来食品与全球发展”(Ⅲ-5 )论坛正式开始,联合国粮食及农业组织首席科学家Ismahane Elouafi博士进行了精彩的开场致辞,她表示快速发展的基因测序和组学技术为农业生产力及营养质量提升提供了全新的解决方案,本次分论坛的举行对于促进可持续目标下的未来农业发展有重要意义。

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随后,加州大学戴维斯分校食品科学与技术系食品健康研究所主任、“食物元素周期表”计划 (PTFI)首席科学家Bruce German博士和加州大学戴维斯分校农业与环境科学学院高级研究员Howard Shapiro博士针对PTFI及其国际合作做了详细报告。

PTFI是洛克菲勒基金会于2019年发起的一项全球计划,旨在建立一个食物生化成分和功能的公共数据库,加速未来农业和未来食品的研究和创新,解决生物多样性丧失、土壤健康下降、儿童营养不良、食物过敏、疾病等全球农业和健康问题。

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中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所研究员黄张春芝博士以《利用基因组学工具重新设计基因及马铃薯生产》为题,展示了“优薯计划”相关科研成果,利用基因组学和合成生物学技术,对马铃薯育种和繁殖方式进行颠覆性创新,实现二倍体马铃薯育种,引领马铃薯产业绿色革命。

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深圳国家基因库主任、分论坛主席王韧博士发表《深圳国家基因库:资源保藏、基因数字化、组学大数据,助力未来粮食、农业发展》主题报告,介绍了国家基因库三库两平台(生物样本资源库、生物信息数据库、生物活体库、数字化平台、合成与编辑平台)的业务架构,以及以此为基础推出的生命大数据平台(CNGBdb),并着重阐述了国家基因库在支撑农业资源保藏、促进信息数字化、推动数据库建设及分析工具开发等方面的国际合作进展与成果。

他指出,长期以来,国家基因库将测序数字化作为对包括种子资源在内的各种农业遗传资源进行永久保藏和可持续利用的重要手段,将生物样本与组学数据贯穿起来。这一独特范式有利于深入开展科学研究、持续探索农业遗传资源的核心秘密,对于未来农业和未来食品的可持续发展将起到不可限量的基础作用。

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最后,王韧博士代表深圳国家基因库对各位与会嘉宾的到来再次表示感谢,并展望了未来农业的可持续发展方向,期待更多具有世界领先水平的重大科学发现和原创性的技术突破引领未来农业创新发展。

在由深圳国家基因库承办的“大数据分析与生物样本库”(Ⅲ-1)和“未来农业、未来食品与全球发展”(Ⅲ-5 )两场ICG-15分论坛上,与会的国内外专家就数据安全与共享、大数据/基因组技术创新实践、未来农业发展新模式建言献策,在现场及线上的千余位专家、来宾中引发了强烈反响和热烈讨论。两场分论坛的成功举办,为多领域交叉融合搭建了一座高水准、国际化的沟通交流平台,有效助推大数据赋能生命科学、医学、农业创新发展。

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