科普

科研“吃鸡”,CNGBdb带你走SCI上分之路

2019-05-24 328鸟类基因组

我不是麦兜,我没有会做"包鸡纸 包 鸡包纸 包鸡"的麻麻,但是我爱“吃鸡”,不论是“大吉大利”的那种,还是“人民广场”的那种。

“吃鸡”那么久,关于鸡你了解多少?

  • 玩家版:苟、舔包、落地成盒、伏地魔、送快递、安全区&毒圈、幻影坦克、过桥费、跑毒...
  • 吃货版:肯大爷家的39元炸鸡桶又回来了、麦叔叔家的也还行、汽锅鸡、白切鸡、三杯鸡、辣子鸡...
  • 科研版:黑尾原鸡、灰纹原鸡、绿领原鸡、红原鸡...

科学家们还抽空搞了一个鸡的数据库:ChickVD

2005年北京大学生命科学院的研究人员开展了鸡(Gallus gallus)基因组测序研究,并以红原鸡(Red jungle fowl)基因组序列为参考序列,鉴定了310万个非冗余DNA变异序列,其遗传图谱包括遗传标记,性状位点,cDNA,人类与鸡同源序列,为禽类遗传学功能和进化研究提供基础。

科研“吃鸡”,CNGBdb带你走SCI上分之路

对于科研萌新,科研上最大的bug就是去哪儿找数据和文献,来CNGBdb,你想要的数据文献全都有,比如上面提到的ChickVD就在CNGBdb上。

CNGBdb还整理了鸡的数据集,包含一系列鸡的研究数据,如鸡(Gallus gallus)基因组研究、鸡变异数据库建立(Chicken Variation Database, ChickVD)、鸡性染色体研究及与其他哺乳动物的比较分析、鸡听觉机制研究、鸡肠道微生物参考基因目录研究、产蛋遗传改良候选基因资源研究、藏鸡(Tibetan Chickens)在高海拔环境中对缺氧和高剂量紫外线辐射适应性研究等。

数据类型包含测序数据、变异数据、转录组分析数据等,数据量超过3T。该数据集将对以鸡为模式生物的基础科学研究、利用遗传标记和基因芯片等现代技术家鸡生物学(如抗病、生长速度、产蛋量等)和遗传育种等研究具有重要的指导意义。

参考文献:
[1] Wang, J. ChickVD: a sequence variation database for the chicken genome[J]. Nucleic Acids Research, 2004, 33(Database issue):D438-D441.
[2] 饶友生, 张细权. 鸡dbSNP数据库的检索与应用[J]. 生物信息学, 2007, 5(1).

上一篇下一篇