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#经典回顾#裸鼹鼠基因组研究

2019-03-09 728哺乳类裸鼹鼠基因组

裸鼹鼠是一种神奇的啮齿目动物,主要分布在东非。它善于挖掘,不会得癌症,超级耐缺氧,社会结构像昆虫,冷血变温像爬行类,利用果糖像植物,逃避衰老像伏地魔……除了变漂亮,裸鼹鼠简直什么都能做到。

迄今为止,科学家们都没有发现任何一只野生裸鼹鼠患上癌症。可能的原因有几个:

首先,裸鼹鼠的基因组里有许多抑癌基因比如ARF基因,而缺少那些癌症易感性基因。裸鼹鼠的基因组和细胞状态都极其稳定。

其次,裸鼹鼠细胞里有一种透明质酸聚合物,这种分子会触发一个特别强大的机制,“早期接触性抑制”,细胞一旦“感觉太挤了”就会停止分裂。哪怕有细胞癌变,分裂几轮后也会造成细胞挨挤触发这种机制,癌细胞也就无法疯狂增殖了。

另外,裸鼹鼠代谢率低,又长期处在低氧环境中,氧化损伤少。这也降低了裸鼹鼠罹患癌症的几率。

科学家们使用全基因组鸟枪法测序策略,采用SOAPdenovo组装方式,测序深度20X,并组装了线粒体基因组。

研究结果

  1. 基因组水平上裸鼹鼠与其他哺乳动物关联:该研究通过比对单拷贝直系同源组,构建了包含裸鼹鼠与其他哺乳动物的系统发育树。

  2. 裸鼹鼠与癌症疾病相关研究:为了进一步研究裸鼹鼠抗癌症机制,该研究分析了裸鼹鼠癌症抑制蛋白p16Ink4a 和p19Arf的编码基因,并构建了系统发育树。

讨论

本研究通过对裸鼹鼠基因组的测序和分析,揭示其基因组与癌症抵抗的分子机制,变温,无毛和耐低温,改变视觉功能,昼夜节律和味觉感知等特征的相关关系。通过研究可以深入了解裸鼹鼠的特殊寿命和极端环境生存的能力。揭示裸鼹鼠的极端特征与基因组之间的关系,为理解衰老、癌症、推进生物进化和生物医学研究等领域提供了机会。

引用

  1. https://songshuhui.net/archives/100207
  2. Fang X , Fushan A A , Huang Z , et al. Genome sequencing reveals insights into physiology and longevity of the naked mole rat[J]. Nature, 2011, 479(7372):223-227.

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