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简介
脚本
输入
输出
leiden
简介

cluster cells into subgroups by leident

脚本
输入
任务名称变量名称类型描述
*
      main
    project_nameString
      项目名称
    
*
      main
    anndataFile
      输入对象格式：anndata
    
*
      main.leiden
    use_weightsBoolean
      如果为True,则在计算中使用图中的边权重(更强调更强的边).
    
*
      main.leiden
    resolutionFloat
      控制聚类粗糙度的参数值.值越大,簇越多.如果将分区类型重写为不接受解析参数的分区类型,则设置为无.
    
*
      main.leiden
    n_iterationsFloat
      leiden算法要执行多少次迭代.大于2的正值定义要执行的迭代总数,-1使算法运行,直到达到最佳聚类.
    
*
      main.leiden
    memoryString
      任务运行的内存数量,注意1.取值范围为0.25核-32核,另外还可选48核和64,CPU必须为0.25核的整数倍;2.内存取值范围>为1GB-512GB,且内存必须为1GB的整数倍3.CPU/内存配比值必须在1:2到1:8之间
    
*
      main.leiden
    dockerString
      --
    
*
      main.leiden
    directedBoolean
      是按有向图还是无向图.
    
*
      main.leiden
    cpuString
      任务运行的CPU数量,注意1.取值范围为0.25核-32核,另外还可选48核和64,CPU必须为0.25核的整数倍;2.内存取值范围为1GB-512GB,且内存必须为1GB的整数倍3.CPU/内存配比值必须在1:2到1:8之间
    
输出
任务名称变量名称类型描述
*
      main
    clustfileFile
      通过填写 this.xxx将输出文件地址返回到对应表格 xxx 列
    
*
      main
    h5adfileFile
      通过填写 this.xxx将输出文件地址返回到对应表格 xxx 列