简介
脚本
输入
输出
GWAS
简介
genome-wide association study (GWA study, or GWAS), The software GAPIT was used for correlation analysis.
脚本
输入
| 任务名称 | 变量名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|---|
| * GWAS | Y | File | 表型 |
| * GWAS | PcaTotal | Int | 主成分分析中协变量PC的个数 |
| * GWAS | Model | String | GWAS分析选择的模型 |
| * GWAS | GM | File | 基因型数据,包含染色体和每个SNP的碱基对位置 |
| * GWAS | GD | File | 数字格式的基因型数据 |
输出
| 任务名称 | 变量名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|---|
| runGapit | outpdf | Array[File] | 输出图像结果 |
| runGapit | outcsv | Array[File] | 输出表格结果 |