2019-09-17 6640文献解读
关于海滨城市,有一种炫富是它们独有的——开海:每年9月,只要准备好你的胃,生猛海鲜5分钟到达现场...
海鱼,算是生猛海鲜中的主力军啦,也是餐桌上的常客,吃鱼这么多年,你知道鱼是卵生还是胎生嘛?
专业分析:
因为知道有鱼子酱这个东西,所以大多数人以为鱼都是卵生,其实不是的,鱼的繁殖方式有卵生(如鲤鱼、鲫鱼等),胎生(如灰星鲨和真鲨等),还有卵胎生(如许氏平鲉)...
卵胎生从字面理解就是卵生和胎生的混搭产物,混搭的原理大概是这样纸:以许氏平鲉为例,雌雄鱼11~12月交尾后,精子进入雌性的卵巢腔中,等待至次年的3~4月卵子成熟后才进行受精,胚胎在雌性卵巢内经过1个月左右的孕育孵化后,母体直接生产仔鱼。
吃过叫不出名系列:它在你家乡叫啥?
许氏平鲉,北方餐桌上的常客,在大连叫黑鱼,在青岛叫黑头鱼...
许氏平鲉特殊的生殖方式,为鱼类卵胎生进化提供了研究资源。今年5月,以许氏平鲉为研究对象,中国海洋大学、青岛海洋科学技术国家实验室联合华大基因,在生物进化领域权威期刊《分子生态资源》(Molecular Ecology Resources)发表了其最新研究成果,该研究在国内首次解析了鱼类卵胎生的进化特征。
鱼类的生殖方式有卵生、胎生、卵胎生,许氏平鲉独特的生殖方式是卵胎生还是胎生一直没有定论。
用全基因组序列和转录组分析,解析了其基因组特征和不同发育时期卵巢表达谱,利用免疫荧光杂交等技术对卵巢中的精子进行定位。
获得许氏平鲉染色体水平的基因组:结合PacBio、BGISEQ‐500以及Hi‐C平台将组装序列的约99.86%锚定到24条染色体上,确定了基因组中35.4%的重复序列和24,094个蛋白‐编码基因。
透明带蛋白(ZP)将精子保留在卵母细胞的包膜内,基因组中孵化酶家族基因成员(HCE1-like)发生了扩张,为消化透明带蛋白释放出精子做了充足的准备。
许氏平鲉卵巢壁具有类似哺乳动物子宫的功能:卵巢膜中“妊娠”相关信号通路的基因以及与胚胎植入相关的基因(如胎盘形成、血管形成、氧气运输等)显著富集或者特异性高表达,且卵巢中有丰富的血管系统,这暗示着许氏平鲉卵巢有类似于胎生动物的子宫及胎盘的功能,可为胚胎提供营养和氧气。
本次研究中基因组数据揭示了一种不同寻常的硬骨鱼生活史策略的进化过程,为研究非哺乳类脊椎动物的胎生提供了坚实的基础,也为许氏平鲉的生态和进化研究提供了宝贵的资源。
这些相关测序数据及组装数据均已保存在国家基因库生命大数据平台(CNGBdb),项目编号:CNP0000222 ,组装编号:CNA0000824 。
参考文献
He Y, Chang Y, Bao L, et al. A chromosome‐level genome of black rockfish, Sebastes schlegelii, provides insights into the evolution of live birth[J]. Molecular ecology resources, 2019.
图片来源:均来自于参考文献,如有侵权请联系删除。
本文部分信息来源于公众号“海洋知圈”(ID:ocean_circle)