这是CNGBdb携手各领域一线科研工作者开讲组学系列课程『第四期』
题目:打开微生物世界的秘钥『宏基因组技术』
直播时间:2019/7/25 19:30-21:00
报名方式:
宏基因组,一个自带“跨界体质”的神奇技术,应用领域从环境生态一路杀入医学诊断,成为病原微生物诊断新风口;其数据挖掘可以从生物多样性分析到未知蛋白结构预测...本期课程将从实验到分析,向您全面介绍宏基因组技术。
MGISEQ 2000
PE200 真菌ITS1
利用Snakemake搭建分析流程:https://snakemake.readthedocs.io/en/stable/
练习下载地址:ftp://ftp.cngb.org/pub/course/wexin_course/Meta_genomics/
运行方式:
snakemake –s snakefile_amplicon_pe –n
snakemake –s snakefile_amplicon_pe –j 8