2021-07-28 1710CNGBdb
Microbiome是一份开放获取的期刊,其收稿范围包括对人类、动物、植物或环境中微生物组的研究。
2021年2月,来自复旦大学、清华大学深圳国际研究生院、德国莱布尼兹环境医学研究所和深圳华大生命科学研究院的专家团队合作在Microbiome杂志上发表文章“Characterization of the human skin resistome and identification of two microbiota cutotypes”,揭示中国汉族人群皮肤微生态宏基因组特征,为进一步探索皮肤微生物功能、利用皮肤微生物改善皮肤状态提供了理论基础。此项研究中的测序数据已存储于国家基因库生命大数据平台(CNGBdb),项目编号:CNP0000635。
2019年1月,来自马斯特里赫特大学和深圳华大生命科学研究院等单位的研究团队在《Microbiome》杂志发表其最新研究成果,通过对281名6~9岁的健康儿童肠菌进行分析发现,母乳喂养持续时间和学前饮食生活方式(蛋白、纤维和奶制品摄入等)对学龄儿童的肠道微生物群有影响,其中饮食方式通过影响肠道菌群还能与葡萄糖、氨基酸代谢和胰岛素稳态产生特定关联。此项研究的宏基因组测序数据已存储于国家基因库生命大数据平台(CNGBdb),项目编号:CNP0000037。
Microbiome优先考虑发表关于宏基因组学方法或新型生物信息学工具的开发和应用的研究、关于群落/宿主相互作用的研究(重点是结构-功能关系)等,其对超越描述性组学调查的研究特别感兴趣,包括从机制上支持提出的微生物组功能实验或理论方法,并在可能的情况下建立因果关系。
Research article:是发表原创研究的一种形式。
Commentary:通常由编辑部约稿,分为两种形式 1)第一种形式是对最近发表或即将发表的文章或试验的讨论;2)第二种形式更多的是编辑性的,涵盖与期刊范围相关问题的一个方面,例如讨论新技术对研究和治疗的影响 。
Letter to the Editor:是对之前在Microbiome 或其他期刊上发表文章的大量重新分析。
Methodology:应该提出一种新的实验或计算方法、测试或程序。所描述的方法可能是全新的,也可能是现有方法的更新版本,文稿必须描述在现有基础上可证明的进步。该方法需要经过良好的测试,最好(但不一定)是以证明其价值的方式使用。
Microbiome announcement:其独特之处在于允许研究人员报告重要宏基因组学数据集的初步分析和表征,而无需报告来自数据的实质性科学进步。其旨在让研究人员在科学进程的早期将他们的数据发布到公共存储库,从而有利于科学研究。Microbiome announcement需要说明数据收集的科学动机、样本来源、实验设计、数据集规模和测序技术,以及数据或样本的任何独特之处。
Review:主要目的是为成熟的主题提供系统和实质性的覆盖,对特定领域的进展进行评估,和/或对新兴技术进行批判性评估。通常由编辑部约稿。
Short report:适用于扩展以前发表的研究,包括报告附加的对照和其他环境下的确认结果,以及阴性结果、小规模临床研究、临床审计和病例系列。
Software article:应该描述一种可能具有广泛用途的工具,其代表了比之前发布的软件(通常通过与可用相关软件的直接比较来证明)的重大进步。
其中,Research article、Methodology、Microbiome announcement、Short report、Software article(生物命名法除外)还需要符合Microbiome对数据、元数据和分析脚本的可用性,实验对照的使用,生物命名法,描述微生物组研究术语等方面的标准。
具体标准可参见:https://microbiomejournal.biomedcentral.com/submission-guidelines/preparing-your-manuscript/research-article