2021-04-29 7742CNGBdb
近期,深圳华大生命科学研究院生物多样性基因组学课题组频传喜讯:6个月以来,团队在国际顶尖期刊Nature、Cell上连续发表6篇重大科研成果,其中3项研究更被选为封面故事:
深圳华大生命科学研究院生物多样性基因组学课题组,主要研究方向之一是利用比较基因组学开展物种宏观演化格局和机制的研究。
多年来,团队发起并领导了多个具有重大影响力的国际基因组学研究项目,如万种鸟类基因组计划(B10K)、脊椎动物基因组计划(VGP)、反刍动物基因组项目、全球蚂蚁基因组研究项目、地球生物基因组计划(EBP)等,在基因组演化及相关研究领域开展了大量的开拓性工作,取得了一系列原创性研究成果。(了解团队详情:http://zhanggjlab.org/)
科研项目的顺利推进,既需要科研团队尽心竭力、集体攻关,也离不开设施平台充当后盾、鼎力支撑。作为上述6大成果相关项目的发起或重要参与单位之一,国家基因库(“国库”)从基因测序、计算资源、数据存储和共享等方面,为之提供了重要的平台及资源支撑。
国库建立了全球领先的基因数据产出中心——数字化平台,具备Pb级的年数据产出能力、全面的应用技术能力,可广泛支撑各类科研、产业和民生项目。
上述6项成果所涉及的部分测序任务依托国库的数字化平台完成,为项目的开展建立了优质的数据基础。
国库建立了高效、安全的生物信息数据存储及分析平台——生物信息数据库,具备PB级的数据存储能力、高达691万亿次/秒的计算能力,可为科研项目的数据处理及分析提供有力的计算资源保障。
上述项目的基因组组装及数据分析,便主要由国库的生物信息数据库提供计算能力支撑。
为促进生物信息数据的共享、利用,上述项目的基因组、转录组测序及组装等数据,均已上传至组学数据共享及应用平台——国家基因库生命大数据平台,可供研究者下载使用。
登录国家基因库生命大数据平台(db.cngb.org),搜索如下编号,即可获取相关数据:
267种鸟类基因组测序及组装数据:CNP0000505 鸭嘴兽基因组测序及组装数据:CNP0000130 针鼹基因组测序及组装数据:CNP0000697 ; 转录组测序数据:CNP0000779 原始辐鳍鱼类基因组测序及组装数据:CNP0000841 非洲肺鱼基因组组装数据:CNP0001614
普通狨猴父母本基因组组装数据:CNA0018880
深圳国家基因库作为我国首个获批筹建的国家级综合性基因库,长期以来积极参与国际重大科学项目,促进生物多样性资源数字化和多组学研究,推动生物多样性样本和数据资源的全球共享,支撑基础科研开展与成果突破,致力于为生物多样性保护以及人类可持续发展提供保障。
我们期待与更多科研机构、产业单位在更多领域通力合作,践行国家赋予国库的使命,以领先的设施平台和技术实力,为行业注入核心力量,助力提高科研效率、促进行业繁荣、建立开放稳健的行业生态圈。
如果您有意愿与国库携手同行,请通过以下方式联系我们(工作日9:00-18:00):
邮箱: P_cngbps@cngb.org;
电话:0755-3394 5579
查看研究成果全文:
https://www.nature.com/articles/s41586-020-2873-9 https://www.nature.com/articles/s41586-020-2871-yhttps://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)00090-8https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(21)00089-1
https://www.nature.com/articles/s41586-020-03039-0https://www.nature.com/articles/s41586-021-03535-x
* 注:部分图片来源于网络,如有版权问题请联系。