2021-03-17 1766CNGBdb
2019年2月5日,华大团队在国际顶级学术期刊Nature旗下子刊Nature Biotechnology上发表了全球最大人体肠道细菌基因组集(Culturable GenomeReference, CGR)研究成果。该研究获得了6000多株肠道细菌,最终构建了1520株高质量的肠道细菌基因组草图,为肠道微生物组研究提供了大量全新的参考基因组数据,同时将肠道菌群的功能分析提升到新维度,这也是首次通过大规模培养的技术手段获得如此多数量的高质量细菌基因组数据。CGR还通过《基因组蛋白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 简称GPB)组织的领域同行专家评审,成功入选2019年度“中国生物信息学十大应用”。上述研究中产生的大量菌株资源和基因组数据研究中所有测序数据已保存在CNGBdb,项目编号:CNP0000126。
《Nature Biotechnology》是一份涵盖生物技术的科学和商业的月刊。它出版了与生物、生物医学、农业和环境科学相关技术/方法的新概念,并涵盖了这项研究的商业、政治、伦理、法律和社会方面。
Nature Biotechnology接收研究论文的核心领域包括:核酸与蛋白质分子工程;分子治疗(治疗基因、反义、siRNAs、适配体、脱氧酶、核酶、多肽、蛋白质);大规模生物研究(基因组学、功能基因组学、蛋白质组学、结构基因组学、代谢组学等);计算生物学(算法和建模),再生医学(干细胞,组织工程,生物材料);成像技术;分析生物技术(分析物/大分子的传感器/检测器),应用免疫学(抗体工程,异种移植,T细胞治疗);粮食和农业生物技术;环境生物技术等。
Nature Biotechnology的稿件类型有:Article、Letter、Brief Communication 、Resource、Analysis、Correspondence、Matters Arising、News and Views、Book Review、Review、Commentary、Perspective、Feature、Patent Article、Careers and Recruitment、Primer。
Article:一项实质性的新颖研究,往往涉及多项技术或方法。正文(不包括摘要、在线方法、参考文献和图例)为3000字。摘要一般为150字。文章有6个显示项(图和/或表)。作为指导原则,文章允许最多有50个参考文献。
Letter:一项重要的新研究成果。这种格式以150字左右的引言段(不是摘要)开始,概述背景、原理、主要结果和意义。正文字数控制在2000字以内(不包括摘要、在线方法、参考文献和图例)。作为准则,Letters允许最多有30个参考文献。Letters的展示项目(图和/或表)不应超过2~3个。
Brief Communication:报告了一个高质量和广泛的兴趣简明的研究。不得超过3个印刷页。简要通讯以简短的无参考文献的摘要开始(3句话,不超过70个字),摘要将出现在Medline上。标题限10个字(或90个字符)。正文一般为1000~1500字,包括摘要、参考文献和图例,不含标题。简要通讯一般不超过2个显示项目,作为指导原则,简讯最多允许有 20 条参考文献。
Resource:提供了一个大的数据集(如一个细胞器或组织中蛋白质的综合列表,一个全基因组抗体库,几个不同实验室对细胞或试剂的联合分析),具有广泛的用途和意义。正文(不包括摘要、在线方法、参考文献和图例)约3000字。摘要一般为100~150字,无参考文献。Resource的展示项目(图和/或表)不超过6个。作为指导原则,Reseources允许最多50个参考文献。
Analysis:Analysis是对现有数据(通常是来自芯片或其他高通量平台的大型基因组、转录组或蛋白质组数据集)进行新的分析,或描述在技术比较分析中获得的新数据,从而得出对广大读者具有重要意义的新颖结论。正文(不包括摘要、在线方法、参考文献和图例)约3000字。摘要一般为100~150字,无参考文献。Analysis的展示项目(图和/或表)不超过6个。作为指导原则,Analysis最多允许有50个参考文献。
Review:综述是对某一研究领域的最新发展进行的权威性、平衡性和学术性的调查。对平衡的要求并不阻止作者提出一个特定的观点,但如果在这个领域存在争议,作者必须以公平的方式对待它们。综述通常在3000~4000字,也鼓励插图。作为一个指导方针,允许最多100个参考,在特殊情况下可能有例外。综述的范围应该足够广泛,不应被单个实验室的工作所主导,特别是不应被作者自己的工作所主导。
*由于篇幅有限,其他稿件类型的具体要求可参见:https://www.nature.com/nbt/about/content
Nature Biotechnology的编辑流程,可以概括为以下几个步骤:
《Nature Biotechnology》提供研究文章的提前在线出版(AOP)。在同行评审之前或之后拒稿的稿件,作者可以按照编辑决定邮件中提供的链接,轻松地将稿件重新投稿到《Nature》系列的其他期刊,在大多数情况下,无需重新格式化或上传文件。
编辑:尐尐呅
图片来源于Nature Biotechnology官网