DATApla11: Multi-omics study for Medicinal Plants
2021-11-02
4965 18
创建人: zhanglei2@genomics.cn
更新人: wangmei@genomics.cn
To better examine the pharmaceutically active components and key genes of medicinal plans devoted for traditional human medicine, the Multi-omics study for Medicinal Plants dataset summarizes a series of “-omics” technologies analyse data (genomics, transcriptomics, proteomics, and metabolomics) from 200 selected medicinal plants, explores the mechanism about how they will play an increasingly important role in future pharmaceutical research, fills the data gap in medicinal plant chemistry and biology.
Medicinal Plants
Multi-omics study

P
中草药多组学研究 来源: CNGB Project ( ID CNP0000432 )

描述: 构建200种重要药用植物样本资源库,产生200个物种的转录组数据,借助比较转录组学和代谢组学、通过差异表达基因分析和组学关联分析手段筛选出潜在的中草药活性成分及其关键基因。本项目对200种中草药转录组和代谢组学分析,将填补数百种中草药组学基础数据的空白。

数据类型: Raw sequence reads

样本范围: Multispecies

相关领域: Medical

递交者: 保明秀(baomingxiu); 深圳华大生命科学研究院

公开日期: 2020-06-10

更新日期: 2019-04-28

DOI: 10.26036/CNP0000432

统计:
  • 组装: 140
  • 样本: 407
  • 实验: 324
  • 测序: 324
数据大小: 2.81 TB 前往FTP

描述: 本数据库通过对200多份重要中草药转录组和代谢组学测序并分析,辅助基因组学数据,构建重要药用植物样本资源库和数据库,并借助比较转录组学和代谢组学,通过差异表达基因分析和组学关联分析手段筛选出潜在的中草药活性成分及其关键基因。本数据库对于今后开发运用合成生物学和代谢工程来合成药用天然产物有着奠基作用,为实现大规模的构建药用植物甚至绿色植物基因组数据平台提供数据基础和技术支持,并助力中医药的基础科学研究和应用研究。

数据类型: Genome sequencing and assembly, Raw sequence reads, Metabolome

样本范围: Multiisolate

相关领域: Medical

递交者: 保明秀(baomingxiu); 深圳华大生命科学研究院

公开日期: 2021-11-02

更新日期: 2021-11-02

DOI: 10.26036/CNP0002107

统计:
  • 组装: 404
  • 样本: 442
  • 实验: 455
  • 测序: 455
  • 代谢: 1
数据大小: 6.42 TB