数据递交

2025-01-08 16:49:04
2025-04-20 17:12:34
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支持的数据类型

CNGBdb的公益性数据递交归档服务包含核酸序列归档(CNSA)和 时空数据库归档系统(STOmicsDB

CNSA:支持实验测序(FASTQ,BAM等),组装,单细胞,变异,代谢,蛋白,序列(GENBANK)等多种数据类型的归档服务。详情可以查看CNSA handbook

STOmicsDB:提供空间组学数据的归档和可视化服务。详情可以查看 STOmicsDB submission handbook


常见问题

1 如何递交数据?

递交流程分为四步:

  • ​创建【项目】​:新建项目,填写项目基本信息(如标题、研究内容等)。创建成功后,系统自动生成项目编号(CNP开头,如CNP0000001)。
  • ​创建【样本】:需要根据物种选择相关的样本模板,并填写相关的样本元信息,如物种名、来源等。
  • 上传数据文件:通过FTP、Aspera等方式上传数据文件(如FASTQ、BAM等)到CNGBdb服务器。
  • 创建【数据】递交:根据数据类型,新建数据递交,并填写相关元信息(如关联项目编号,文件名,MD5值等),将其关联到相关的【项目】和【样本】,完成数据归档。

请注意,CNGBdb会在您完成【数据元信息】递交后审核相关的项目,样本和数据。

2 数据递交后的审核时间是多久?

在您完成【数据】元信息递交后,CNGBdb会在1-3个工作日内完成项目和数据的审核。

3 我可以向已有的项目中追加数据吗?

同一项目下可追加样本和数据。如果您需要向已有的项目中追加数据,请新建相关的数据递交(如【实验测序】的递交),然后在项目编号栏填写您之前的项目编号,系统会自动关联到原有项目。

4 如何获取文章中需引用的项目编号?

完成项目递交后,系统会自动生成一个项目编号(以“CNP”开头,例如:CNP0000001)。这个编号就是您可以在文章中引用的项目编号。
请注意:项目编号只有在项目达到设定的公开日期后,才能被公开访问。

5 如何在文章中引用项目编号?

如果您的数据已提交至CNGBdb,您可在文章中引用相关的项目编号(例如:CNP0000001),引用方式可参考:

  • 英文:

           The data that support the findings of this study have been deposited into CNGB Sequence Archive (CNSA)[1]  with accession number CNPXXXXXXX.

  • 中文:

           该研究的相关结果数据已递交到生命大数据平台的序列归档系统(CNSA) [1],项目编号:CNPXXXXXXX。

[1] Weiwen Wang, et al. The China National GeneBank Sequence Archive (CNSA) 2024 update. Horticulture Research. 2025 Feb 6;12(5):uhaf036. doi: 10.1093/hr/uhaf036. PMID: 40224325

6 如何获取审稿人访问链接?

如果您的项目尚未公开,但需要为编辑或审稿人证明数据已经储存于CNGBdb,请发送邮件至 datasubs@cngb.org,说明您的项目编号和相关需求,我们会为您生成一个临时的审稿人链接。

请注意,该链接仅展示元数据(如项目描述、样本信息),不包含原始数据文件,且到期后会失效,因此不能直接放在文章中


联系我们

如有任何疑问或需要进一步帮助,可以通过以下方式联系我们:

  • 邮箱:datasubs@cngb.org
  • 联系电话:0755-33945586(办公时间:周一至周五(法定节假日除外))